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科学家在人类肠道中鉴定出超过14万种病毒

  病毒是地球上数量最多的生物实体。现在,威康桑格研究所和EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员已经发现了超过14万种活在人类肠道中的病毒,其中超过一半是以前从未见过的。
  这篇发表在《细胞》杂志上的报道,包含在世界各地收集的28,000多个肠道微生物样本的分析。研究人员发现,这些病毒的数量和多样性惊人地高,这些数据为研究这些病毒如何影响人类健康开辟了新的途径。
  人类的肠道是一个令人难以置信的生物多样性的环境。除了细菌,成千上万的病毒叫做噬菌体,可以感染细菌,也生活在那里。
  众所周知,肠道微生物群的不平衡会导致过敏、肥胖或肠道疾病等。但是对于我们的肠道细菌以及感染它们的噬菌体在人类健康和疾病中所起的作用知之甚少。
  威康桑格研究所(WellcomSanger Institute)和EMBL的欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的研究人员使用一种名为"元组学"的DNA测序方法,探索并编目了28,060个人类肠道基因组和2,898个从人类肠道培养的细菌分离基因组中发现的病毒物种的生物多样性。
  分析确定了超过14万种活在人体肠道中的病毒,其中超过一半是以前从未见过的。
  研究所博士后Alexandre Almeida说:"重要的是要记住,并不是所有的病毒都是有害的,而是肠道生态系统的一个组成部分。首先,我们发现的大多数病毒都有DNA作为遗传物质,这与大多数人所知道的病原体不同,比如SARS-CoV-2或寨卡病毒,即RNA病毒。其次,这些样本主要来自健康个体,他们没有任何特定的疾病。能看到有多少未知物种生活在我们的肠道里,并试图解开它们与人类健康之间的联系,这是非常有趣的。"
  在发现的数万种病毒中,发现了一种新的高度流行的病毒--一组被认为具有共同祖先的病毒,作者称之为Gubaphage,这是第二大流行。病毒在2014年发现的crAssphage之后,人类肠道中出现了clade。
  这两种病毒似乎都能感染类似类型的人类肠道细菌,但如果不进行进一步的研究,就很难知道新发现的Gubaphage的确切功能。
  韦尔康桑格研究所这项研究的第一作者路易斯卡马里洛格雷罗博士说:"我们工作的一个重要方面是确保重建的病毒基因组具有最高质量。严格的质量控制管道和机器学习方法使我们能够减少污染,获得高度完整的病毒基因组。高质量的病毒基因组为更好地理解病毒在我们体内的作用铺平了道路。肠道微生物群,包括发现新方法,如来自噬菌体的抗菌药物。"
  这项研究的结果构成了肠道噬菌体数据库(GPD)的基础,GPD是一个高度管理的数据库,包含142,809个非冗余噬菌体基因组,它将成为研究噬菌体及其在调节肠道细菌和我们自身健康方面所起作用的宝贵资源。
  韦尔康桑格研究所这项研究的高级作者特雷弗劳利博士说:"噬菌体研究目前正在经历复兴。人肠 病毒恰逢其时,可作为指导今后病毒研究的生态和进化分析的蓝图。"
  更多资料:Camarillo-Guerrero, L.F., et al. (2021). Massive expansion of human gut bacteriophage persity. Cell. DOI: doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.029

男孩戴风扇睡觉被吹面瘫夏天天气比较热,很多人都喜欢睡觉的时候不关闭空调和风扇,其实这是非常不理智的行为,最近就有一个男子,因为一直吹着风扇睡觉,醒来以后发现自己的脸歪了。好在通过就医,现下情况已经有了好拿来吧你!这档宝藏美食综艺不该被埋没大家好,我是小肥良。你有多久没看到一档厨师真人在线PK的综艺了?无论是央视的厨王争霸还是TVB的美女厨房,都是一代人的经典回忆。而如今的美食综艺呢?大多是明星做菜的真人秀罢了。当然从陈梦到侯志慧,为什么奥运冠军都离不开保温杯?大家好,我是小肥良。最近的奥运比赛,我发现了一个很有意思的细节。女子乒乓球单打决赛,陈梦对阵孙颖莎。陈梦用保温杯喝水孙颖莎呢?喝冰水结果是用保温杯的赢了,喝冰水的惜败。前几天举行的日清,一家被泡面耽误的沙雕公司大家好,我是小肥良。日清拉面,应该是大家比较熟知的方便面品牌。它家旗下的合味道一直深受各国消费者的欢迎。日清的历史最早可追溯到1958年,当时世界上第一包方便面鸡汤拉面,就是诞生自从敢死队总舵主到市值管理阶下囚今天看到翔哥出狱了,真是让人觉得时间过得很快呀,你要问徐翔是谁,那咱们可以好好聊聊,我这里说得不完整或者不对的地方大家可以在评论区指出,但是有一说一呀,徐翔不正当违法犯罪行为不可取家里最容易忽视的冰箱杀手,四个字大家好,我是小肥良。最近,南京发生了一起食物中毒事件。吕女士喝了在冰箱存放2天的鸡汤后,出现了头痛低热腹泻等症状。最终她被医院诊断为脑膜炎,住进了ICU病房。而李斯特菌,正是吕女士网页上的搜寻建议除了方便之外,还带来了什么用途以及隐忧?每天在浏览器输入关键字时,搜寻引擎都会自动帮我们补齐后缀词汇或是给我们相关搜寻建议,这些搜寻建议实际上带给我们哪些正面的帮助?又同时带来了哪些隐忧?google浏览器我们每天都会在不缴电费吃电也发电的细菌,到底还有什么是细菌不会的很久很久以前,科学家发现了,细菌可以利用超多乱七八糟的东西来活下去(靠树树倒,靠人人跑,还是靠自己最实在),即使在没有氧气也没有养份的状况下也能活得亭亭玉立。就算是啥也没有,光喀电60年来悬而未决的难题要飞多高才算一场名正言顺的太空旅行?随着次轨道旅行蓄势待发,数十年的地球大气边界的争议依然持续。太空时代的崭新阶段即将到来。以往太空轨道中的强权争霸已不复见,取而代之的是建立在新型低轨道载具之上的商业活动。美国的维珍荔枝挑选存放小妙招,不要直接放入冰箱哦炎炎夏日,又到了吃荔枝的季节。荔枝是南方盛产的水果,其果肉清香,味道甘甜独特,汁多肉脆,深受人们的青睐。一骑红尘妃子笑,无人知是荔枝来,可见北方宫廷中人对荔枝的痴迷程度不是一般的水上门服务暖人心,特事特办解难题刘珍莹记者赵修彬上门服务暖人心,真情服务感客户,特事特办解难题,便捷服务送进门,让服务更有人情味,让客户体验更贴心,这就是平安保险客户李先生的真实感受。近日,平安人寿黑龙江双鸭山支
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