我国科学家率先绘制完成全球首个家鸡全基因组完整图谱

　　央广网北京2月22日消息据中央广播电视总台中国之声《新闻超链接》报道，近日，中国科学家以我国特有家鸡品系胡须鸡为材料，在国际上率先绘制完成家鸡的全基因组完整图谱，实现了基因组图谱绘制技术在经济动物中的首次应用。
　　全基因组图谱部分内容（图片来源：西南大学）
　　绘制家鸡的全基因组完整图谱有多难？为什么要给鸡测基因组？未来，我们可能吃上由基因研究培育出来的鸡吗？
　　用中国特有的鸡做研究
　　2004年，国际团队已经合作绘制出了鸡基因组图谱草图。随后十几年里，鸡的基因组信息虽不断完善，但受限于测序技术，基因组图谱始终不够完整。这一次，西南大学生命科学学院教育部重点实验室徐洛浩教授课题组，鉴定了原先缺失的6条染色体，终于组装出了完整的家鸡基因组图谱。该研究成果已发表在《美国科学院院刊》，图谱信息也开放共享，提供给所有科学家，希望可以促进交流合作，共同创造有价值的研究。
　　研究团队此次使用的是长读长测序技术，这种新的测序技术，恰好能弥补之前的短板。鸡总共有39条染色体，大小各异。之前缺失的6条染色体都特别小，是点状染色体，使用之前的短读长测序技术难以覆盖。之前的测序技术需要将DNA打断成很小的片段，测序后再重新拼接成全基因组；此次采用的长读长测序技术则尽量不打断DNA，减少了后续的拼接过程。利用新的测序技术，研究团队揭开了这6条染色体的神秘面纱这些染色体虽小，基因数量却不少，其中不少还是具有保守功能的基因。
　　惠阳胡须鸡，颌下有张开的胡须状髯羽
　　此次研究的胡须鸡，是中国特有的家鸡品系。胡须鸡是广东的地方品种，肉质鲜美，在当地颇受欢迎。徐洛浩教授表示，选择胡须鸡是一个巧合，但也有出于学术研究的考虑鸡的驯化很可能是在中国发生的，因此测定家鸡的全基因组信息时，最好是以中国的品种作为代表。
　　育种进入分子时代
　　未来的家鸡育种，或许就用得上此次绘制的全基因组完整图谱。
　　育种在过去主要是通过杂交实现，但现在已经进入分子时代，基因组信息可以提供不同的育种思路。例如，可以将全基因组中的具体位点与具体的性状联系起来，在未来育种的时候，通过基因测序，精准且全面地选择出包含这些优良性状的个体，极大加快育种选择进程。不过，要实现从基因组图谱到育种的产学结合，还需要学界与业界进行更多合作。
　　家鸡养殖基地（图片来源：西南大学）
　　值得一提的是，此次公布的家鸡全基因组完整图谱，也是继去年人类基因组完成图公布以来，首个发表的脊椎动物基因组完成图。
　　目前，全球科学家正在为很多个物种绘制全基因组完整图谱，这些物种包括水稻、玉米、牛羊等重要经济物种。为什么是鸡首先被测出来，徐洛浩认为主要有两个原因：一方面，鸡本身的基因组相对简单，测序比较容易成功；另一方面，相关研究团队的研究起步较早，全基因组图谱绘制工作甚至略早于人类基因组图谱。在充足的准备之下，突破也来得更快。随着高通量测序的发展、计算存储能力的提升，未来将会有更多基因组完整图谱被绘制出来，更多难题将被攻克。
　　徐洛浩表示，未来研究团队希望能够收集更多的种质资源，并从中挖掘育种素材。除家鸡育种外，他们也将目光投向罗非鱼等物种身上。在分子时代，基因组信息定会给育种带来不一样的突破。
　　监制：白中华
　　记者：鹤佳
　　编辑：马露丝杨扬彭毓姬
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