影片火烧红莲寺完整故事线

　　雍正年间，有人告密少林寺反清复明，雍正懿旨将少林寺赶尽杀绝，永绝后患。
　　大量少林僧人亡于清廷的铁蹄之下，只有少部分僧人四处逃亡，但朝廷紧追不舍，势必要斩草除根。身为俗家弟子的方世玉靠着一身高强的武艺，带着师叔侥幸逃到西北荒漠，并且遇上了从良小姐‘豆豆’。豆豆也是个苦命人，曾经为了讨生活不得不沦落风尘。现如今，从良还乡，只想看看家里人。同是天涯沦落人，方世玉和豆豆一见钟情，一旁的师叔也看出了两人之间的端倪，鉴于清廷的强大，他建议两人还是逃命要紧，但方世玉是不妥协，发誓一定要战胜清廷，救出师父师兄弟。
　　没过多久，杀手血滴子率重兵赶到，更是想用大炮炸死他们。慌乱中，师叔被炸成重伤，豆豆也被活捉，面对千兵万马，方世玉毫无惧怕之心，可即便他武功再高强，但也不能不顾及师叔和豆豆的安危。迫于无奈，他只能缴械投降，而结果竟是，血滴子不仅抓住了方世玉，更是一刀让师叔当场领了盒饭。
　　之后，方世玉和豆豆以及其它被俘获的少林僧人，被押入了关押重犯的红莲寺。这里白骨累累，阴森恐怖，进来的人很少能够活着出去，活脱脱的一个人间地狱。 进入寺内，方世玉看。到了不可置信的一幕，大批少林弟子被囚禁至此，不分昼夜地做着苦工，为精兵铸刀打铁，稍有不慎就会被当场砍死，丢入万人坑。
　　这时，一个身穿锦衣华服的老者登场，他就是红莲寺的大统领神公。看到神公驾到，大家将不约而同地扑跪在地，豆豆因为有美丽的妆容，则被血滴子当作礼物送给了神公，神公对此甚是满意。随后，神公的属下‘翠荷’向方世玉等人宣布，红莲寺的规矩，若有反抗就会被格杀勿论。因为少林弟子看不惯神公的所作所为，想要上前教育他，结果刚上吊桥，下面就突然伸出无数钢钉，将他死死钉在原地。
　　方世玉忍无可忍，他走出来拯救师兄，可还未等它靠近，神公就按下旁边的把手，两把暗器顿时而来，紧接着浮桥，一分为二，两人命悬一线。方世玉苦苦支撑着，可最终还是眼睁睁的看着师兄被活活烧死。方世玉怒目以对，擒贼先擒王，他一脚踹走翠荷，纵身一跃，直逼神公。可就在关键时刻，洪熙官突然出现，挡在神公面前，他自称恩断义绝，现已投靠神公。
　　方世玉怒骂洪熙官不知廉耻，并用独门绝技，鹤海无涯对战鬼虎神功，只是虎鹤双形，只能两败俱伤，眼看不能取胜，方世玉眼疾手快，朝着神功扔出一根长矛，长矛刺入神公身体，神公却毫发无伤。他将长矛缓缓抽出，然后随后与扔，直接将方世玉死死地钉在石壁之上。鉴于洪熙官的良好表现，神公将一个婢女赏赐于他。
　　不曾想此举引起翠荷的妒忌，她找到洪熙官直接表达爱意，却不料被洪熙官委婉拒绝，方世玉被丢进了一个尸骨堆中，剩下全是自己的同伴。
　　另一边，神公垂涎豆豆（小龙女）的美色，命下人将其梳洗打扮了一番，因为豆豆的爽快耿直，让神公很是满意，神宫答应她可以满足她一个愿望，豆豆希望神公可以给方世玉一条生路，为了美人，神公爽快答应，殊不知放虎归山后患无穷。
　　在地牢中，方世玉看到两只嬉戏打闹的老鼠，忍不住往后退缩，突然一只手伸了过来，方世玉吓的面容失色，原来老头儿竟然是他的师傅～至善大师。至善师傅在这里待了三个月，靠一只老鼠生存了下来，两人重逢，甚是欣喜。
　　不久后，神公为了兑现自己的承诺，带着豆豆来到地牢，将重伤垂死的方世玉从万人坑里放了出来，并找人救治了他。自此，豆豆也心甘情愿任由神公摆布，并且做出一副任君采摘的模样。
　　一天，洪熙官发现红莲寺运来了一批炸药，暗中窥视之时，竟然被翠荷和血滴子发现。然后翠荷追上了洪熙官，但还是因为喜欢而放走了他，而方世玉也加入了苦工队伍，他和众僧一样，手脚戴着镣铐，每天打铁造兵器。不过他并没有麻木，遇到压迫，他照样毫不犹豫地反抗，血滴子见他是个硬茬子，决定要他来一场生死决斗，方世玉欣然接受。
　　可当他来到生死台，对手竟是师兄洪熙官，不过他也是满清走狗，方世玉毫不手软，使出鹤海无涯，洪熙官脚力惊人，把石柱都踢断了，方世玉上场就很被动，只能来回躲避，台下全是利剑，两人打斗中，方世玉不慎，差点跌入陷阱。危急关头，洪熙官及时出手将他拉了上来，此时神公拿出地图，一脸的戏虐。
　　原来洪熙官明着投靠大清，实则趁机摸清红莲司的机关布局，方便日后救人。然而事情并没有那么容易，洪熙官被拆穿计谋，索性和方世玉一起联手杀出重围。可红莲寺里机关重重，他们还没走几步，就被瞬间落下了两道铁门困住，脚下铁门翻转，许多僧人被关了进去。更可怕的是，侥幸逃脱的僧人也被清兵的火枪杀害。
　　方世玉他们根本不是对手，两人慌不择路，情急之下只能再次跳进地牢的尸骨堆中，再次见到了至善大师，看到洪熙官，二话不说上来就是一巴掌，随后才知误会了他。三人商议对策，由于地图被抢，眼下只能用炸药炸掉红莲寺的机关，这样才有机会逃离魔窟。
　　恰巧的是，万人坑里竟有一条通往外面的暗道，两人顺着密道上去，正好进入神公的寝殿，看到豆豆被五花大绑，方世玉立马冲上去救人，好在神公不在，在此看守的翠荷根本不是对手，没战几个回合就被打趴在地，眼看即将命丧于此，洪熙官及时求情，毕竟之前对方帮过自己的，方世玉救下豆豆，突然传下机关开启，两人掉了下去，瞬间毒剂开始释放，洪熙官背着翠荷一起离开，而掉下地道的方世玉和豆豆竟发现这里是神公的老巢，放着许多各种年轻女子的人体标本，她们形态各异，犹如睡美人一样安静祥和。翠荷，一方面为了报答洪七公的救命之恩，一方面也因为内心喜欢洪七公，就带着他去火药库寻找炸药，炸毁红莲寺，但最终翠荷还是被机关一斩，顿时毙命。
　　与此同时，方世玉和豆豆意外发现一道暗门，刚要离开，却被清兵首领血滴子拦住去路。两人拼杀之际，瞬间地动山摇，原来是洪七公找到了那批炸药，准备将红莲寺付之一炬，血滴子意识到大事不妙，想趁乱逃走，方世玉紧追不舍，将其逼到墙面上，血滴子不慎被火引燃，当场被火烧死。洪七公和师傅趁机救出了其他被困的同门，但因为爆炸，山洞的路被堵死。
　　众僧在一尊佛像面前跪拜，祈求佛祖显灵，至善师傅拆下三柱香，突然佛像周围出现了大量的火枪，顷刻间众僧死伤无数。显然这又是神公的计谋，看来想逃出红莲寺一定要把神公铲除。
　　神公披头散发现身，两人合体，虎鹤双形。然而神公也有绝世武功在身，他用内力将颜料射出，威力堪比火墙，就算是兄弟联手，也不是他的对手。不过方世玉趁神公得意之时，泼了他一身黄色颜料，神功的双眼被遮蔽，两人赶紧用铁链将其擒住。这时好巧不巧，至善师傅备好了炸药，准备将石像炸毁，而就在爆炸的瞬间，巨石绷进山洞，正好砸中半空中的神公当场送他进了地狱，人间炼狱红莲寺因此被烧毁，最后众人逃出生天。
　　方世玉和豆豆则是苦尽甘来，成为了一对煞羡旁人的神仙眷侣。影片到这里就结束了，作为一部。新拍武侠电影，它的风格极其另类，掺杂了黑暗惊悚恐怖的元素，大反派神功残暴，古人丝毫不尊重生命，同时藐视神佛，唯我独尊，让江湖上的腥风血雨来得直白而残酷，或许这才是真正的江湖。
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