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一种新型快速简便的SARS2基因分析系统

  来自大阪大学和北海道大学的研究人员开发了一个分析SARS-CoV-2突变的系统,该系统比现有方法简单得多,而且速度更快。
  Credit: Osaka University
  SARS-CoV-2是这次新冠大流行的病毒。我们已知突变在基因组SARS-CoV-2已经发生和传播,但是这些突变有什么影响呢?目前研究SARS-CoV-2基因突变的方法非常复杂且耗时,因为冠状病毒有很大的基因组,但是现在大阪大学和北海道大学的一个团队已经开发了一个快速的、基于聚合酶链反应(PCR)的反向遗传学系统来分析SARS-CoV-2的突变。
  此系统使用聚合酶链反应(PCR)和循环聚合酶延伸反应(CPER)重建病毒基因组全长cDNA。这一过程不涉及细菌,细菌可以引入更多不想要的突变,只用两周就能产生传染性病毒粒子。以前的方法花了几个月的时间,而且程序非常复杂。
  "这种方法使我们能够快速地检查SARS-CoV-2突变的生物学特征,"该研究的主要作者ShihoTorii说。"我们可以利用CPER技术制造每一种变异的重组病毒,并与原本病毒进行比较,检查它们的生物学特性。"从较小的DNA片段中构建出SARS-CoV-2的大循环基因组,然后用CPER构建一个可行的病毒基因组,并用于感染合适的宿主细胞。9天后可发现大量传染性病毒颗粒。
  "我们相信我们的CPER方法将有助于理解SARS-CoV-2的传播机制和发病机制,并有助于确定新出现的突变的生物学意义,"相应的作者松村佳原(Shiho Torii )解释说。"这将加速新冠肺炎新型疗法和预防措施的发展。"研究小组还建议,CPER方法的使用将允许研究人员将"报告基因"插入到SARS-CoV-2基因组中,以"标记"感兴趣的基因或蛋白质。这将使人们更好地了解SARS-CoV-2是如何感染细胞和引起新冠肺炎的,有助于开发治疗方法。CPER方法甚至可以产生一种不能引起疾病的重组病毒,可以作为SARS-CoV-2的一种安全有效的疫苗。
  在SARS-CoV-2人群中一直出现突变,以及这些突变的作用以及它们是否会影响疫苗效力的问题。"我们的简单而快速的方法可以让全球各地的科学家对突变体进行定性,这是我们对抗SARS-CoV-2的重要一步,"该研究小组的TakasukeFukuhara说。
  更多内容:Shiho Torii et al. Establishment of a reverse genetics system for SARS-CoV-2 using circular polymerase extension reaction, Cell Reports (2021). DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109014

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