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增强AI在生物医学中的可信度,多国专家搭建AIMe平台

  编译/文龙
  在过去的二十年里,高通量技术的巨大进步与成本的降低使得产生大量的生物医学数据成为了可能。与此同时,使用人工智能方法检查和评估这些数据的全新可能性已得到发展,高维数据也已经能够以准确且稳健的方式进行数学建模。
  虽然 AI 在生物医学研究中具有明显的潜力,但其在转化为临床研究的道路上却十分坎坷,原因之一就是 AI 的决策往往是不透明的、难以解释的,有一些模型甚至不能完全复现。这也是 AI 在许多实际应用中所面临的共同问题。
  正如一些科学家所说的那样:「为了得到广泛的应用,人工智能系统必须得到监管机构的批准,并被标准化到一定的程度。」
  为了增强 AI 模型在生物医学中的可信度,来自欧洲、北美的两支国际研究团队相继在《 Nature Methods 》杂志上发表了文章,希望能够为生物医学 AI 建立起统一的标准,以增强人们对人工智能在生物医学研究乃至临床实践中运用的信任。
  其中一篇文章中提出: 这些标准是推动科学突破、推动知识进步以及确保研究结果可以被另一组科学家复现的关键。
  这些标准将允许科学家专注于下一个突破,而不是花时间重现原研究作者创造的轮子。
  打造专属社区平台
  由德国、丹麦、以色列、奥地利、荷兰、比利时、巴西、西班牙多所大学的专家学者组成的国际研究团队提出了 AIMe 生物医学研究人工智能注册表(registry)。
  AIMe registry 是一个社区驱动的报告平台,旨在提高生物医学 AI 模型的可用性、可靠性和可重复性,可通过 https://aime-registry.org/ 进行访问。
  论文链接:http://dx.doi.org/10.1038/s41592-021-01241-0
  文章详细介绍了 AIMe 提供的三种主要服务:创建新报告、查询数据库和贡献。
  AIMe registry 概览。 首先是创建新报告,这涉及到 AIMe 标准的第一个版本,即 AIMe2021 标准,共分五个部分:元数据、目的、数据、方法和再现性,每部分有相应的问题。通过依次填写问卷,研究人员可以以结构化形式展示他们的 AI 模型。报告示例可通过 https://aime-registry.org/database/获取。
  创建报告的填写流程。 创建的新报告将添加到 AIMe 数据库中,可供社区成员搜索、并对现有报告提出问题、发表评论。 贡献则分为两个部分,允许感兴趣的成员通过提供改进建议或请求加入委员会共同打造 AIMe 标准的未来版本。
  由于生物医学 AI 是一个快速发展的领域,AIMe 标准也必须不断适应新的发展,因此预设了每年一次的修订过程。
  AIMe 还主动承诺开放同行评审、开放方法、开放知识多样性、开源代码四个开放科学原则,确保社区的良性发展。 如何定义可复现性
  另一支由美国、加拿大、英国多所高校的专家学者组成的研究团队拥有相同的观点,也提出了类似的流程,但他们着重制定了可复现性标准的细则。
  为了使生命科学中的机器学习分析在计算上更具可重复性,该团队从数据、模型和代码的公布情况、编程实践、工作流自动化程度方面提出了标准,以确保生命科学中的机器学习分析值得信赖。
  论文链接:https://doi.org/10.1038/s41592-021-01256-7
  由于在许多情况下很难强加一个将工作分为「可复现」和「不可复现」的单一标准,因此我们提出了一种包含三档不同严苛程度的计算可复现性标准的分级: 青铜:公开了分析中使用的数据、模型和代码。 白银:增加了(1)分析的依赖项可以通过单个命令下载和安装;(2) 记录了实现的关键细节,包括运行脚本的顺序、使用的操作系统和系统资源要求;(3) 分析中的所有随机参数都设置为确定的。 黄金:增加了使用单个命令即可使分析重现。
  生命科学中机器学习的可复现性标准。
  可复现性的黄金标准是完全自动化。当一项工作符合这个标准时,其他研究人员就可以几乎不需要花费精力就可以复现它。
  作者解释说:「虽然很多人会将模型的可复现性视为二元属性,但我们更愿意将其考虑为一种反映复现所需时间的滑动比例。」
  这些标准的制定再加以相应的激励措施,不仅会有助于加速该领域的研究,还有助于可重复编程的实践。在实际研究中,不可复现的代码虽然会在短期内减少作者的工作量,但从长远来看会增加未来研究人员甚至原作者自己的工作量。
  最后,作者强调:「如果我们希望生命科学在值得信赖的可验证研究方面处于领先地位,那么为计算可复现性设定标准是一个很好的起点。」
  参考内容:
  https://techxplore.com/news/2021-08-standard-artificial-intelligence-biomedicine.html
  https://techxplore.com/news/2021-08-standards-machine.html

奥里森马登这一生,为自己而活让我们成为生活的掌控者许多人嫉妒别人,遇事斤斤计较,到处吹毛求疵,什么事情都只能看到丑陋的一面。他们整天焦躁烦恼,愤世嫉俗的悲观情绪如毒药一样侵蚀着全身,这是多么遗憾的事!这些人的眼睛只能看到丑恶与不平今天也要用心过生活把孤独当做基本条件唯有拥有在黑暗中也能一个人毅然决然行走的力量,我们才能与擦身而过的他人构筑深刻的联系。如果是三人以上的聚会,我便尽可能不去参加。我原本就不善社交,要和一群人见面令我很头疼。而且,我任仲文新中国70年发展密码引领复兴征程的强大力量中国共产党以国家的整体利益和长远利益为旨归,具有强烈的历史责任感与舍我其谁的担当精神,坚守为中国人民谋幸福为中华民族谋复兴的初心和使命。正因为秉持这样的初心与使命而一往无前不懈奋斗中国枪支弹药库全球首曝光这七款武器,威震四方声驰惊白帝,光乱失青春。杀气腾幽朔,寒芒泣鬼神。今天的中国,发射一颗远程火箭弹,70公里外地动山摇中国自主研制的7。62毫米转管机枪枪身全长1。1米,有效射程1000米。每分钟可发中国版放牛班的春天,妞妞合唱团音乐是飞跃大山的力量妞妞合唱团是四川凉山州普格县大槽乡中心小学一个由40个留守女孩组成的合唱团,两位音乐教师吉布小龙和阿吾优发在返乡教书时,带着一群纯真善良爱唱歌的孩子们,用原创歌曲编织大山深处的音乐一本新书揭示了写在北美岩石中的古代生活故事南达科他州的黑山是拉什莫尔山的所在地,是约翰德沃夏克在北美实地考察中多次返回的几个地方之一想象一个世界,鸽子大小的蜻蜓在半米长的腿上翱翔,2米长的千足虫滑行,20公斤的蝎子捕食。大盛通印刷加冕全市首家双绿印刷企业近日,工信部发布的第五批绿色制造名单公示中显示,区内企业北京盛通印刷股份有限公司(以下简称盛通印刷)同时出现在绿色工厂绿色供应链管理公示名单中,成为全市首家绿色工厂与绿色供应链双认知名纸企被多名供应商起诉申请查封设备冻结资产自7月底以来,据法院公开的信息,位于山东枣庄的远通纸业(山东)有限公司突然被多家供应商因买卖合同纠纷施工合同纠纷等起诉,申请查封了远通纸业包括银行存款轿车土地等多项财产。根据法院公多部门晒举措推进江苏生态文明20条落地生根9月17日,江苏省生态环境厅联合常州市政府举办一七一期一齐一起江苏生态文化沙龙,以别出心裁的形式开了一场新闻发布会,对江苏生态文明20条(简称20条)进行发布及深度解读,以引导公民湖北省第一轮第一批生态环保督察回头看将启动根据湖北省生态环境保护督察实施办法等有关规定,经省委省政府批准,湖北省第一轮第一批生态环境保护督察回头看将全面启动。省委省政府将组建5个督察组,对列入第一批督察的武汉市黄冈市襄阳市新形势下中国纸张供需变化及趋势影响中纸联发布新形势下中国纸张供需变化及趋势影响。报告显示2019年中国纸浆消耗9609万吨,纸张产量10765万吨,纸张销售总量为10704万吨。其中各细分纸种产量销量数据(单位万吨
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