国自然热点细胞自噬相关基因研究思路
原文转自:一起实验网
更多生信思路获取请戳https://www.yiqishengxin.com/ 背景介绍
自噬(autophagy)是一种高度保守的溶酶体降解途径。
研究证实,自噬在体内参与了许多生理和病理调节过程,如细胞分化发育、细胞异常结构退化、免疫应激、肿瘤抑制、抗衰老、细胞死亡等。自噬与肿瘤发生之间的关系是一把双刃剑,在癌变前细胞中,自噬有助于维持生理组织的稳态,并通过根除受损的细胞器来避免癌症的早期发展。另一方面,在已确定的癌症中,活跃的自噬通量也为肿瘤细胞的存活和生长提供能量和大分子前体。自噬在肿瘤发生、维持免疫和肿瘤进展中起着至关重要的作用。
自2016 年日本细胞生物学家大隅良典因其在阐明细胞自噬的分子机制和生理功能上的开拓性研究获得诺贝尔奖以来,自噬引起了众多科研工作者的广泛关注,成为当前生命科学/基础医学研究的一大热点。近年来,以细胞自噬为研究对象的高分文章不断涌现,也成为国家自然科学基金的资助项目中炙手可热的研究领域。
今天小编就带大家详细了解一下分析细胞自噬的目的和临床意义。研究路线
分析目的
通过差异分析筛选疾病的细胞自噬相关差异基因(校正前后的箱线图、火山图、热图、韦恩图,8-10个图);
对细胞自噬相关差异基因进行生物学功能及通路富集分析(气泡图、柱状图、circos图,4-6个图);
单因素cox、Lasso回归分析构建疾病风险模型,并通过生存分析、ROC曲线以及外部验证集对模型进行检验(森林图、拟合曲线、散点图、折线图,8-12个图);
基于构建的风险模型,对样本进行分组以及临床特征分析(小提琴图、箱线图、折线图、散点图、瀑布图等,8-12个图);
多因素cox构建预后模型并绘制列线图,在临床中对患者状况进行评估(森林图、列线图、折线图,3-5个图)。临床意义
在基因水平探索与疾病相关的自噬相关基因的特征模型;
结合临床数据绘制预后列线图,可以指导患者的个体化治疗;
挖掘疾病中存在差异的生物学过程,对疾病的治疗提供潜在的方向;
对患者的生存进行预测,以便对患者采取更精确的个体化治疗策略,包括更积极的治疗和更密切的随访。推荐范围
肿瘤内科、风湿免疫科、心血管内科、心血管外科、呼吸内科、神经内科、神经外科、骨科、妇产科、耳鼻喉科、皮肤科、消化内科、内分泌科、儿科、口腔科、肾内科、泌尿外科、血液内科、老年科、胸外科、眼科、皮肤性病科等。 结果示例
参考文献
White E. The role for autophagy in cancer. J Clin Invest. 2015,125(1):42-46.
Liu X, Ma B, Chen M, Zhang Y, Ma Z, Chen H. Prognostic Autophagy-Related Genes of Gastric Cancer Patients on Chemotherapy. Front Genet. 2021, 12:720849.
Deng G, Wang W, Li Y, Sun H, Chen X, Zeng F. Nomogram based on autophagy related genes for predicting the survival in melanoma. BMC Cancer. 2021, 21(1):1258.编者总结
2021年国自然医学部有关细胞自噬的课题达到358项,可见自噬仍是国自然的热点之一。 但更多的细胞自噬思路还有待探寻,对于该思路有兴趣的老师可以联系小编哈~
为什么说常务副县长是副处级,而县委组织部部长只是正科级?有网友问我一个问题,他在县级机关工作,最近他们常务副县长和县委组织部部长相继作了调整,在召开干部会议的时候,常务副县长宣读的是市委任命决定,而县委组织部部长宣读的是市委和县委任命决
周末午餐这样吃,简单又营养,吃完全身暖和冬日生活打卡季觉得今年特别冷,家里冷,出去外面也冷,上午出去的时候,风吹得我迈不动脚步,回来的时候,整个身子都是被风吹着在飘,虽然有太阳,可还是冷得直抖,我把自已捂得严严实实,帽子
论叠穿,我只服毛衣衬衫!时髦洋气,让你从冬天时髦到春天叠穿的艺术永垂不朽,不仅能够帮助我们把握不同单品的有效组合,也能够打造身材的亮点,帮助我们扬长避短,对于不同身材的女人都非常友好。但是要完美把握住使用的叠穿法则,却需要我们在穿搭设
Sentionel统一异常处理五。统一异常处理BlockException在上述规则测试中,当违反规则时,出来的异常信息页面不够友好和统一,我们可以通过设置统一的异常处理类,针对不同规则显示不同异常信息。创建一
机械硬盘永不为奴?拒绝向SSD认输,未来继续降价占市场目前全球硬盘市场,可能最主流的产品要算是512GB和1TB的SSD了,而且基本都是NVME接口的。基本上读写速度都在3000MBs以上,价格也比较便宜,不到400元就能买到的1TB
读取速度高达10GBs!影驰推出PCIeGen5固态硬盘据videoCards报道,影驰为发烧友推出了其最新产品,这是世界上首批基于最新PCIe标准和超快DDR5内存的SSD之一。首先,今天推出的HOFExtreme50SSD只是一个产
C11使用stdmakeunique避免数据成员默认清零头号有新人本人最近在优化一个原有项目时发现了一个很奇特的事情在此跟大家分享一下。这个项目由于某些历史原因使用了stdmakeunique来创建一个拥有唯一使用权的对象指针。但是在经
电脑桌面文件删除了怎么找回?电脑桌面,是我们把常用的工具和文件放置的界面,这个可以根据小伙伴们的喜好与习惯进行放置。而放置在多文件,都是要记得定期清理的。毕竟频繁的使用电脑,总是能产生文件,保存在电脑上,及时
突然宣布将于29日关闭服务!12月22日,糗事百科发布公告,宣布糗事百科网站及APP将于2022年12月29日000关闭服务,享年17岁,并发布了社区内充值余额服务内容的处理方式,糗事百科的公众号将会继续运营
英特尔蓝戟ARCA770显卡深度评测大家好,我是Wallace显卡日报,一名电脑硬件发烧友。英特尔显卡目前最大的优势是100无矿,但是游戏方面我感觉还要再打磨很长一段时间。我这周自费买了张蓝戟ARCA770,继续写一
华为与诺基亚续签专利交叉许可协议No。1,继华为与OPPO宣布签订全球专利交叉许可协议之后,今天华为与诺基亚宣布续签双方专利许可协议。(技术掌握在自己手里的感觉就是好。)No。2,小米集团总裁王翔宣布将于12月3