3天集齐国际顶级学术期刊CNS!这是家什么机构?
3月1日3日,华大集团参与的3个研究成果连续3天发表在了《自然》(Nature)、《科学》(Science)和《细胞》(Cell),瞬间集齐国际顶级学术期刊CNS!
这是对科研人员付出的认可,更是2023年华大科研成果第一个里程碑
下面,让小编给您盘点一下这3个成果:Cell:发布迄今最大动物基因组参考序列
3月2日,由中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等机构组建的国际研究团队,完成了迄今为止最大动物基因组参考序列南极磷虾基因组组装,并揭示了南极磷虾适应极端环境和群体历史演化的分子基础。相关研究成果于Cell杂志在线发表。
图片来源于Cell官网
被称为海上金矿的南极磷虾是南极洲生态系统里的关键物种,是鲸鱼、海豹、海狗、企鹅等动物的主要食物来源。它体长35厘米,体重一般不超过2克,却是地球上生物量最大的动物。
本研究构建了约48GB的南极磷虾基因组序列,这是迄今为止最大的动物基因组参考序列,约为人类基因组的16倍,比已发表的超大基因组非洲肺鱼和澳大利亚肺鱼大2030。研究发现,南极磷虾重复序列含量高达92。45,这源于南极磷虾基因组重复序列的两次爆发式扩张。
此外,研究人员还对南极磷虾的极端环境适应性,地域差异、气候变化等对南极磷虾群体的影响进行了研究。
Nature:迄今为止对脊椎动物新生突变率最广泛的研究
3月1日,由浙江大学主导、深圳华大生命科学研究院等参与的新生突变率相关研究成果发表于Nature杂志,这是迄今为止对脊椎动物新生突变率最广泛的研究。该研究通过对68个脊椎动物物种的比较分析,揭示了不同物种胚系突变率差异的根本原因和演化规律。
图片来源于Nature官网
当父母产下后代时,继承了双亲遗传物质的新生命也会产生与父母不同的新性状,其根本原因在于生殖细胞的DNA突变导致了代际之间的基因组差异。
胚系突变(即能遗传给后代的生殖细胞突变)的频率影响着物种长远的演化能力,但是过多的突变会导致疾病,从而对生存造成影响。因此,物种在每一代产生的突变数量存在一定的界限。但在不同物种中,这种代际间新发突变产生的频率并不相同。以往对胚系突变率的研究多数聚焦于单个物种。
本研究通过对涵盖哺乳类、鸟类、爬行类和鱼类的68种脊椎动物、323个家系的高深度基因组测序分析,对每个物种新生突变的发生率进行了准确测量,为理解新发突变发生率的种间差异提供了基础。
另外,本研究还对比了不同物种间的突变率差异、突变率的性别差异,并揭示了影响物种间胚系突变率的关键生活史特征。
研究表明,突变率本身如同其它生物性状一样在不同物种之间存在差异,同时在宏观演化过程中,也会受到其它生物性状的影响。
Science:揭开葡萄驯化的历史
3月3日,在Science杂志的封面研究中,云南农业大学、北京植物所联合深圳华大生命科学研究院等来自17个国家的科研团队,通过对全球3525种野生和栽培葡萄品种的基因组分析,揭开了葡萄驯化的神秘面纱:1。1万年前,在相距1000公里的两地,两次葡萄栽培事件几乎同时发生。这个全新的结论推翻了葡萄驯化的传统理论,为研究葡萄的起源和演化提供了新的起点。
图片来源于Science官网
在更新世,由于生境的持续破坏,恶劣的气候促使了野生葡萄生态型的分离。大约在1。1万年前,在相距1000公里的西亚和高加索地区,两支野生葡萄几乎同一时间经历了驯化。西亚的驯化品种跟随早期农民分散到欧洲,与古老的西方野生生态类型相融合,随后在新石器时代晚期沿着人类迁徙的轨迹多样化为麝香葡萄和独特的西方酿酒葡萄祖先。
除了复原葡萄驯化、栽培的历史,研究还对与葡萄栽培相关的典型性状(包括香气、颜色和花的性别)进行了分析。例如,研究发现了控制葡萄麝香特征的基因,麝香特征相关遗传变异频率没在群体中固定下来,并且其中至少一种等位基因可能对葡萄的健康有害。此外,研究还发现了可能对葡萄果皮颜色产生影响的未知基因。未来,这些发现有望帮助酿酒师改进葡萄酒的品质,并提升葡萄品种对气候变化等压力的适应能力。
多年来,华大借助自身的大平台优势,对多种动植物展开测序,不断破译地球生物基因组信息,包括水稻、家蚕、家鸡、大熊猫、大豆等。截至目前,华大破译的动植物基因组累计全球贡献值占比超39。仅2022年一年,华大在动植物领域发表CNS系列文章达19篇,其中,2篇发在主刊上。
未来,华大将继续深耕生命科学领域,为领域内的基础研究及产业应用贡献更多成果,为生物多样性保护贡献力量。同时,华大也将切实推动基因科技成果转化,实现基因科技造福人类。
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