科普蛋白质的脂化修饰（PTM）

　　蛋白质的脂化修饰
　　蛋白质的脂化（lipidation）修饰是指脂类分子与蛋白质共价结合，从而改变其结构与功能。很多人将脂化修饰看作一种翻译后修饰（PTM），其实有些脂修饰可以是共翻译过程，如NMT催化的豆蔻酰化等。
　　与糖基化相比，脂修饰的一个显著特点是多样性，这与两种生物分子的结构特点直接相关。在生化中，糖与脂是处于两个极端的分子。各种糖类结构与性质极其相似，而脂类恰好相反，不同脂类的结构和性质差异极大。
　　一些常见的脂修饰。Physiol Rev. 2015 Apr; 95(2): 341–376.
　　例如，各种己糖（脱氧糖除外）都是同分异构体，差别只在于是醛还是酮，以及手性问题。而脂肪酸、胆固醇、萜类和磷脂之间结构完全不同，恐怕最大的共性就是溶解性了。
　　糖基的结构决定其连接方式主要就是糖苷键，所以蛋白质糖基化基本都是通过糖苷键。而脂类结构的多样使其与蛋白质的连接有多种方式。
　　蛋白质的S-棕榈酰化。EMBO Rep. 2018 Oct; 19(10): e46666.
　　脂肪酸主要通过其酰基与蛋白相连，包括与氨基形成酰胺键，与羟基形成酯键，与巯基形成硫酯键等。硫酯键是高能键，所以这种连接不稳定，是罕见的可逆脂修饰，称为蛋白质的S酰化（S-acylation）。
　　胆固醇中的活性基团只有3位的羟基，通常与蛋白质末端羧基形成酯键。萜类中的双键虽然比较活泼，但不适合与蛋白质连接。所以异戊二烯化的底物是胆固醇合成的中间物，带有焦磷酸的FPP或GGPP与半胱氨酸的巯基反应，通过硫醚键与蛋白质相连。
　　蛋白质的异戊二烯化。Themedicalbiochemistrypage
　　最常见的脂修饰有四种，前面三种都是纯粹的脂类基团，最后一种是糖脂复合物，即糖基磷脂酰肌醇（glycosylphosphatidylinositol，GPI）锚。它是通过其乙醇胺部分与蛋白质末端羧基形成酰胺键进行连接的。
　　磷脂修饰比较罕见，例如自噬相关蛋白Atg8 / LC3可以被磷脂酰乙醇胺（PE）修饰，这种修饰对于自噬小体双层膜的形成是必不可少的。
　　一般说来，糖基化主要利用其亲水性，而脂修饰则相反，主要利用其疏水性。脂类基团可以提高蛋白质整体或局部的疏水性，使被修饰的蛋白与相应膜结构更加亲和，或者改变局部结构，从而影响其功能。
　　不同膜蛋白的S-酰化位点。Physiol Rev. 2015 Apr; 95(2): 341–376.
　　较大的脂修饰基团，如长链脂肪酸、胆固醇和萜类等，通常用于改变蛋白质整体的疏水性，从而影响其细胞定位和稳定性等。这在膜蛋白和一些信号转导相关蛋白中比较常见。
　　例如，很多小G蛋白激活下游信号通路时都是先与膜结合，而这个过程往往涉及异戊二烯化和棕榈酰化等修饰。异戊二烯化的Ras蛋白通过微弱的膜亲和力与高尔基体结合，当它再被棕榈酰化以后，就会离开高尔基体，与质膜结合。
　　组蛋白赖氨酸酰化种类及分布。Nat Rev Mol Cell Biol. 2017 Feb; 18(2): 90–101.
　　较小的脂修饰基团一般仅改变局部的疏水性和电荷分布等，从而改变局部构象，进而影响蛋白活性。例如，组蛋白的赖氨酸有多种短链酰化修饰，包括丙酰化、丁酰化、2-羟基异丁酰化、琥珀酰化、丙二酰化、戊二酰化、巴豆酰化和β-羟基丁酰化。
　　这些修饰起着重要的调控作用。而修饰基团的来源，主要是细胞代谢产物，特别是脂代谢。所以，脂修饰也是一架桥梁，联通着脂代谢和蛋白质功能，进而影响细胞以至于整个生物体。
　　蛋白质的脂修饰将脂代谢与蛋白质功能调节联系起来。Cell Chem Biol. 2018 Jul 19; 25(7): 817–831.
　　参考文献：
　　1. Luke H. Chamberlain, et al. The Physiology of Protein S-acylation. Physiol Rev. 2015 Apr; 95(2): 341–376.
　　2. 钟鸿英等, 蛋白质翻译后脂修饰的结构和功能分析: 靶向细胞脂信号. 中国科学: 化学, 2013, 43(1): 35-48.
　　3. Pin‐Joe Ko, et al. Protein palmitoylation and cancer. EMBO Rep. 2018 Oct; 19(10): e46666.
　　4. Benjamin R. Sabari, et al. Metabolic regulation of gene expression through histone acylations. Nat Rev Mol Cell Biol. 2017 Feb; 18(2): 90–101.
　　5. Baoen Chen, et al. Protein lipidation in cell signaling and diseases: function, regulation and therapeutic opportunities. Cell Chem Biol. 2018 Jul 19; 25(7): 817–831.