研究发布拟南芥高质量参考基因组

　　拟南芥（Arabidopsis thaliana）作为被广泛应用的模式植物，其基因组序列加快了植物分子生物学研究。在首个基因组发布二十余年后，仍存在大量未填补的缺口区域。在常用的TAIR10/Araport11版本的基因组序列中，存在165个缺口。这些缺失区域可能由高度重复的序列组成，包括端粒、着丝粒、5SrDNA簇和含有45SrDNA的核仁组织区（NORs）。近年来，ONT和PacBio等长读段测序技术的发展为组装高复杂度序列提供了有力工具。近期发表的两个高完整度基因组Col-CEN和Col-XJTU填补了着丝粒等缺失区域，但这两个新的组装仍不完整且有相互矛盾之处。
　　为提供更好的参考基因组，中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组与中国科学院大学汪颖研究组合作，结合长读ONT、高保真的长读PacBio HiFi和短读Illumina NovaSeq测序数据获得了接近完整的拟南芥Col-0生态型的参考基因组Col-PEK。Col-PEK组装填补了包括五个着丝粒在内各区域中的绝大多数缺口。例如，Col-CEN中5号染色体中的缺口均已在Col-PEK中补齐。Col-PEK为目前最为完整的基因组组装，完成了1、3、5号染色体从端粒到端粒的完整组装，仅2号和4号染色体的多拷贝NORs区域尚不完全。Col-PEK组装总长度133.92 Mb，比TAIR10组装长14.77 Mb，即增加了12.4%的序列。在填补缺口之外，Col-PEK还修订了Col-CEN等组装中的拼接错误。
　　Col-PEK组装具有较高的序列完整度，对Col-PEK的注释揭示了重复序列的分布规律，特别是着丝粒区域的CENH3结合区域分布规律和CEN180重复序列分布特征。对编码基因的注释还发现了145个新的＂隐藏基因重复＂，其与已知基因序列高度相似，可能是由新近的串联重复等基因组扩增机制所产生。
　　Col-PEK组装补全了所有着丝粒序列及绝大部分其它缺口，纠正了之前的错误组装。该研究的初步分析展示了重复序列的分布规律，并揭示了一批新基因。Col-PEK参考基因组为植物学科研工作者提供了新的参照序列和重要数据资源。
　　相关研究成果以A near-complete assembly of an Arabidopsis thaliana genome为题，于6月1日在线发表在Molecular Plant上（DOI:10.1016/j.molp.2022.05.014）。研究工作得到国家重点研发计划的资助。
　　图1.不同参考基因组组装的完整度比较
　　图2.基于Col-PEK的基因和重复序列注释

小米12年度旗舰正式发布，搭载全新一代骁龙8售价3699元起2021年12月28日小米年度旗舰新机小米12系列终于正式登场，发布会上，小米为我们带来了小米12小米12Pro和小米12X三款旗舰手机，一同发布的还有MIUI13小米WatchS退场前大跳水，120W快充屏下摄像头，不到半年从4999跌至3239元大家期待许久的小米12系列新机已经发布了，不知道米粉们对于小米12满意不，相比去年的小米11，这次小米12起步价少了300元，来到3699元，不过没有了2K分辨率，而小米12Pro加时逆转豪取七连胜，葛昭宝40分8板撑起山西内线山西VS天津这场比赛天津投了21个三分球，山西对于天津三分线防守的松懈差点让天津拿下比赛。天津场均得分95。4，CBA联赛排名第16，并不是一支特别强的球队，山西场均得分111。2两块钱搞定一道家常美食炸藕丁前几年每年过年回老家，大爸都会炸很多藕丁给我们做零食，这几年各种原因回去的少了，很想念老家各种美食。今年疫情又开始了，过年还不知道能不能回去，自己动手做了这个小零食，孩子很喜欢。BCBA积分榜，浙江第二山西第五，北京首钢掉出八强，广东四战三败2022年的第二天，CBA联赛一共进行了六场比赛，其中有几场比赛打得还是非常激烈的。在焦点大战中，山西队以118112力克北京首钢，送给对手两连败。其他几场比赛中，吉林队10610白马湖的清晨1923年3月8日下午，俞平伯动身前往白马湖。此前俞平伯接到朱自清的信，邀他到白马湖的春晖一聚，恰好前不久俞平伯刚刚辞去上海大学的教职，闲来无事，便搭乘新江天轮从上海出发，3月9日今生我们要去的100个风情小镇（六十三）原创不易，敬请点赞关注！。（五）帝里风光好凝望北国1。黄河岸边的明珠党家村党家村党家村党家村与闻名中外的平遥古城全然不同，又有别于祁县的乔家大院，它是以村寨合一的形式整体设计而成的碳水化合物在身体中有什么作用？碳水化合物对身体有很多积极作用，最常见的就是供应能量，血液里零散的葡萄糖和肝脏中的葡萄糖链子糖原都是身体短中期能量储备的一种形式，长期储备则是脂肪形式。所以，我们首先应该承认糖是身2055岁男性养生的重点是什么？2040岁婚恋事业期性成熟精力旺性成熟且精力持续而旺盛，已经初具男人味，如让人微醉的黄酒。他们是男科泌尿科门诊就诊人群的主力军。常见问题1不洁性生活引起前列腺炎尿道炎或性病。2部分四队交易方案出炉！湖人威少好聚好散，9人互换，老詹喜迎两帮手当下，202122赛季NBA常规赛激战正酣，参赛各队都在为拿到更上一层楼的战绩积极备战中，力争拿到更靠前的排名，以帮助球队在季后赛中走得更远，以登上总决赛的舞台，比赛因此愈加精彩白王哲林被交易至尼克斯，华裔天才称霸NCAA，库里欲拿全明星票王王哲林被交易至尼克斯因为后卫线核心卢比奥意外遭遇左膝前交叉韧带撕裂赛季报销，骑士队这边想要签下湖人队的朗多为球队解决燃眉之急。近日湖人骑士和尼克斯通过三方交易，骑士队终于得偿所愿。

<<<<<<－>>>>>>

公积金3条新政，变相涨工资？已有60个城市响应现在人们找工作除了要看工资是多少之外，还会很关注对方是否帮缴五险一金。现在相信大家对五险一金都相当熟悉了。缴纳五险一金之后，人们就可以享受相应的福利待遇。而社保中的每一项对老百姓来三部门部署推进企业吸纳就业社保补贴直补快办为加大就业政策实施力度，推动政策速享尽享，人社部教育部财政部6月29日发布通知，部署实施企业吸纳就业社会保险补贴政策直补快办行动。通知要求各地坚持突出重点精准施策，注重数据比对部门大数据发展的四大趋势大数据运用于各行各业，包括教育医疗等行业，促进着相关业务的发展。趋势一物联网现今有84亿件物品互相连接，远大于全球人口数不只是桌电笔电或手机等3C产品相互链接，还有物流公司用智慧扫心中有晴空，处处见明媚时光，携着四季的花香叶绿果甜雪莹，翩跹在岁月的迭新里。光阴在成熟与成长的丰盈和清明里，纯澈着流年的芜杂与繁复。阅历生命的风雨，走过生活的阴霾，心中有晴空，处处皆明媚。生命的清欢与生每日一方夏天的空调病都说夏天的命是空调给的但许多夏天的病也是空调给的空调病是吹出来的吗？空调病究竟是个怎样的病？空调病该如何预防？带着这些问题我们一起听听专家的讲解吧！什么是空调病？空调病严格来说不是ScaleAI全球估值最高的数据标注独角兽如何炼成？前哨你好，这里是科技前哨，继续跟你分享新兴科技企业有关的新鲜见闻。今天我们要和大家分享的公司ScaleAI，业务就是做人工智能训练数据标注，在短短6年的时间里，ScaleAI已经成为了媒体人晒数据反驳追梦库里16季后赛每次单挑拿1。14分KD仅0。75直播吧6月29日讯追梦与雷迪克近日制作了联合播客，期间他表示，在杜兰特在勇士那几年，库里在进攻端的得分能力略逊于杜兰特。追梦的此番言论在国外也引起了很多勇士球迷库里球迷的不满，媒体张丰毅乐做妻管严，二婚妻子是我和儿子的感情润滑剂张丰毅是娱乐圈极德高望重的老戏骨，在这40年的人生中，张丰毅创造了很多经典的硬汉角色。霸王别姬的段小楼更是令人印象深刻，在剧中，他呈现了很多影帝级的演技。这些年来，张丰毅的体态更是武则天演员李崇霄51岁早逝，与德国妻子恩爱，女儿出道似热巴最近，娱乐圈里又传来噩耗，实力演员李崇霄去世，终年只有51岁，被很多网友认为是英年早逝。李崇霄演戏有实力，人缘也不错，有很多圈中好友，昔日的合作伙伴曾黎也发文悼念李崇霄的离开。李崇樊锦诗的事业选择简单相信，傻傻坚持如今前往莫高窟的游客，第一站都是离窟30公里的敦煌数字展示中心。数字敦煌和虚拟洞窟，利用信息技术和展示手段，全方位模拟洞窟场景，使游客在进到莫高窟前就能感受身临其境的参观效果。如果酒楼地方风味菜，味道巴适得很鲜椒鱼肚原料鱼肚500克青笋丝150克小米椒圈100克青二荆条辣椒圈200克子姜丝150克豆瓣20克泡椒末40克姜末20克蒜末20克盐10克白糖5克花椒5克花椒油30毫升鸡精味精鲜