研究揭示了乙型肝炎病毒与人类色素相互作用的三维景观
乙型肝炎病毒(HBV)是一种属于肝细胞病毒家族的小包膜DNA病毒,至今仍是一个严重的全球性问题。不加控制的慢性乙肝病毒感染可导致危及生命的终末期慢性肝病,如肝硬化等。
人细胞核内HBVDNA的空间组织模型。
人核HBVDNA,包括共价封闭环状DNA(CccDNA)和整合型HBVDNA,被认为是HBV相关肝病发生和发展的主要因素。
来自中国科学院(CAS)生物物理研究所(IBP)的杨鹏源(音译)教授和北京大学生命科学学院的吉雄(音译)教授强调了HBVDNA在人类细胞中的关键作用,并研究了HBVDNA与人色素的相互作用。他们的研究发表在12月29日上线的《细胞发现》杂志上。
研究人员首先使用了一种高度敏感的技术--3C-高通量基因组全易位测序(3C-HTGTS),在HBV感染的细胞模型中,全球范围内识别HBVDNA-宿主DNA接触。
有趣的是,HBVDNA在宿主基因组,而是优先在活性染色质区域与宿主DNA建立联系。重要的是,3C-HTGTS的数据揭示了另一种HBVDNA,即整合的HBVDNA,可以在人类基因组转录活性区与宿主基因组DNA形成染色质环。
通过对HBVdna与宿主DNA接触的鉴定,发现在HBV cccDNA小染色体上也存在H3K4me1标记区,对HBV转录有很强的影响。
此外,HBV感染会影响宿主基因的表达,并伴有HBVDNA与宿主DNA的接触。
这些发现为cccDNA和HBVDNA整合在人类基因组中的空间组织提供了一个高通量的三维景观,也为进一步了解HBV在未来肝病发展和发展中的调控机制奠定了基础。
更多信息:Bo Yang et al. 3D landscape of Hepatitis B virus interactions with human chromatins, Cell Discovery (2020). DOI: 10.1038/s41421-020-00218-1
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