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突破存储与算力极限,助力生命科学领域破译达芬奇密码

  基因技术作为被大家公认的有可能改变人类命运的关键技术,如今已经渗入到我们的日常生活。通过基因测序,可以对孕妇进行无创伤的产前先天遗传缺陷检测,也可以通过检测肿瘤基因特征片段提早预防癌症,还可以通过基因技术来寻找最优的药物治疗方案。
  目前市场上主要采用的是第二代测序技术。先将整个基因组打乱,切成随机碎片,然后测定每个小片段序列,最终利用计算机对这些切片进行排序和组装,并确定它们在基因组中的正确位置。这个过程看似简单,但基因测序工程动辄需要数万或数十万个基因测序及模型建立,需要很大的计算和存储资源。所以要求HPC平台需要满足以下几点:
  第一,要满足大数据量需求。 基因数据的产出量基本上每18个月就要增加一个数量级,所以数据产出量一直处于快速增长的状态。如某全球最大的基因组学研发机构目前拥有超过200台测序仪,其中用于新生胎儿基因测序每天大约产生10000个样本 ,与数万个正常胎儿几十TB的基因组数据进行差异统计分析,数据计算量巨大,这就必须要求HPC系统具有海量数据存储能力。
  第二,对内存需求量大。 序列对比是所有生物信息学序列分析SA中最主要的计算任务。在后期基因序列分析时,往往会进行序列对比,这就要求要将海量数据一次性载入到内存并加以处理,而不适宜分批导入,这就对内存有了非常严苛的容量要求。
  第三,对计算力要求高。 第二代基因测序技术又包含全基因组重测序、外显子组测序、目标靶向区域测序和转录组测序。每个测序方法所使用的软件繁多,合起来常用的估计有上百个软件了。根据实际测试,目前基因测序所用的专用软件,用GPU来跑还不够成熟和稳定,所以对CPU的性能要求就变得更高。
  针对上述需求,北鲲云自主研发了一站式云超算平台,该平台通过对阿里云、腾讯云、AWS、微软云、谷歌云、华为云等六大主流公有云的资源整合,配合独有的并行计算调度管理模块,能为用户快速构建与安装部署一个"独享式"云端超算中心资源,提供从数据、软件到算力的全流程服务,帮助企业简单便捷的管理大数据,真正做到为企业客户降本增效。
  在算力方面,北鲲云一站式云超算平台能够提供单集群 100,000个计算核心 ,可快速完成全基因序列拼接、比对工作;在数据存储方面,Cloudam云端一站式云超算平台支持 PB级别业务场景 ,内置的并行文件系统可提供极高的IO性能,最高可达208万IOPS,满足了基因测序大文件及小文件并发带宽需求;在软件方面,平台预装了多款基因测序的高性能计算软件,例如BLAST+、Burrows-Wheeler Aligner、BWA、GATK等,用户无需安装,即可开箱即用。 还支持:
  • 实时调用最新硬件资源,且 价格与传统超算资源的持平
  • 极速文件传输,数据的输入/输出速度比传统超算 快10倍以上
  • 支持图形界面、命令行、工作站多种作业方式,灵活便捷
  • 7x24小时全天候技术支持服务,30分钟内响应
  除基因测序外,北鲲云还提供了蛋白折叠、虚拟筛选、分子动力模拟、分子设计、蛋白结构模拟等应用场景的解决方案,助力生命科学领域的研究和发展。

两艘军舰部署亚太,英国再同中国叫嚣?英媒小船,卖土产去的当伊丽莎白女王号航母带着英国皇家海军几乎全部的家当,驶离朴茨茅斯军港之后,英国的亚洲秀就开始了。上个月,历经波折的伊丽莎白女王号航母跋山涉水啊翻山越岭啊,来到了它此行最重要的目的地日本野心藏不住了?2艘准航母即将完成改造,还把矛头对准了我们最近这段时间,本就名存实亡的和平宪法再次迎来了新一轮的挑战。在美国国际战略研究中心举行的海上安全对话会议上,美国海军陆战队司令大卫H伯杰透露了一个消息,他说他们会让美国海军陆战队的美国终将返回阿富汗!美国撤军后议员仍不死心,还想继续祸害中东就在一个多星期以前,随着美军最后一架C17运输机从喀布尔国际机场升空,美国的撤军行动也随之宣告结束,持续了20年时间的阿富汗战争终于告一段落。虽然在近一个月内,美国的撤军行动遭到了俄罗斯无人机问鼎世界第一?应对美国威胁,俄军装备数量超2000架无人机作为新兴的空中作战力量,以零人员伤亡非接触可远程作战等特点,受到各国青睐。特别是在军事领域,无人机更是拉开了非接触战争的新序幕,有专家曾表示,随着无人化智能兵器的大量出现,战数天2炸!美国火箭升空6分钟炸成火球,27国直奔中国空间站探索宇宙是一件非常艰难的事。而要想探索宇宙,那载人航天飞船少不了,火箭也少不了。前者用于保护宇航员安全,后者用于将前者送入太空。所以美国一直在致力于发展更新更好的火箭和航天飞船。不别拿中俄说事啦!美军才是美国最大的敌人,美军事专家亲口承认日前,美国德克萨斯州大学历史系教授里米苏里发表了一篇题为美国军队太庞大,已经损害了自身利益的文章。文章怒批美军是美利坚建国200多年以来,美国为自己挖过的最大一个坑。原因很简单,为这就是潜艇杀手?日本P1巡逻机摔了个狗啃泥,这个杀手不太冷日月穿梭,斗转星移。这个世界很多事情都是在不断地发展变化。还有一句话叫什么来着多事之秋。嗯,你会发现日本似乎正在用自己的实际行动来验证这句话的准确性。不信你看啊,前有安倍晋三卸任,针对中国,美军出新招!F35B战机现身出云航母,日本摊牌了众所周知,二战结束后,作为战败国的日本签订了和平宪法,该宪法明文规定,日本不能制造用于进攻的武器。也正是因为这一限制,日本在军事领域没有快速发展,直到前几年,日本不少军工领域仍然处首相职位鹿死谁手?一夜之间态度大变,菅义伟辞职竟是被逼无奈?不知道大家有没有这么一种感觉,好像自从日本东京奥运会结束之后,日本首相菅义伟已经有好长时间没出镜了?但有道是不鸣则已一鸣惊人啊,最近,菅义伟就成功让世界为他操心了一把。9月3日是中盯上中国东风导弹?解放军黄海实弹射击,美军机连夜出动抵近长期以来,美军利用嘉手纳基地进行在第一岛链内海域的所谓抵近侦察行动。根据相关消息显示,9月4日凌晨,美空军一架RC135S绰号眼镜蛇球导弹监视机从嘉手纳机场起飞并穿过东海防空识别区美军幽灵舰队浮现?导弹藏进集装箱,美媒受中国兵法启发要问世界上哪国军力量最强横,那一定非美国莫属。美军之所以能长时间屹立不倒,除了他拥有先进的武器装备之外,还要归功于他不断发展改进的作战理念。美军相当重视作战理论的研究。以概念推动军
宇宙全息大幻方猜想我有一种直觉,宇宙是一个大幻方,各天体之间在时空的分布上存在与幻方数字分布类似的性质和规律。用幻方性质来研究宇宙天体分布规律,用天文学的有关知识来研究幻方,一定会有很大的发现。一幻荒谬的宇宙大爆炸之说很久一来我们看到的关于宇宙是如何产生的说法都来自西方人的学说宇宙大爆炸理论这个理论目前已经在许多人的脑海中根深蒂固,甚至可以说家喻户晓,但本人认为宇宙大爆炸只是个荒谬的假说,因为在涨知识爱迪生的中国学生,改变了世界道路的规则大家好我是无知君,这三个小知识记得收藏。1红灯停绿灯行,黄灯亮了停一停。这可是每个人从小就会说的顺口溜。但是在19世纪20年代之前,信号灯就只有红色和绿色。交替的间隙很长,并且没有谁偷走了人类三岁之前的记忆?科学证明原来是大脑故意为之首先问你一个严肃的问题,现在回想一下,在你的脑海中还有3岁之前的记忆吗?相信对于这个问题很多人给出的答案都是否定的,并且就在刚刚几秒钟的时间里大家的脑瓜子肯定也是空白的,不过大家别白令海峡因俄罗斯的失误,导致两块大陆无法相连如果从太空俯瞰地球,除了无常住人口的南极洲和孤悬海外的大洋洲,剩下的世界按习惯被划分为所谓的旧大陆与新大陆,旧大陆是指在人类历史上联系紧密的欧洲亚洲和非洲,新大陆就是指15世纪西方天舟二号成功发射,中国科技超越欧美,大国科技的力量中国天舟二号,如同出征的勇士,以1锐不可当的姿态成功发射。整个发射过程可谓是干脆利落,毫不拖泥带水。在这里除了完美,已经找不到别的词来形容天舟二号的发射过程是怎样的?天舟二号的技术动力电池取得新突破钠电池超越锂电池,或将解决电动车缺陷?充电十分钟,电量就能升至90的电池你见过吗?若是商业化产出,价格低廉能够甩掉昂贵锂电池一条街的电池你又了解过吗?一辆电动车40的价格都来源于电池,若是未来发展态势好,电动车的价格将越南抄袭中国33万平方公里的土地,居然有60多个省级行政区越南和中国的关系可以说是一言难尽,曾经作为中国领土,在近代虽然自成一国家也与中国有过亲密的关系,此后两国也爆发过矛盾。如今的越南对于中国的态度充满纠结,但是在越南在一些方面上不仅以贝加尔湖的存在真的合理么?它到底是如何形成的辽阔的东西伯利亚南部,有着如同明镜一样的淡水湖泊,但是在静谧的湖面之下,其最深处达到了足足1637米,平均深度也有着700多米,而他的面积也足足达到了3。15万平方公里,是目前,或新疆随着环境慢慢变好,新疆正在迎来复苏,该不该人工干预新疆作为我国最大的内陆省份,因为有着中国境内最大沙漠的克拉玛依干沙漠,给人留下了新疆干旱又贫瘠的刻板印象。谁能想到,在数十亿年前,新疆地区在地球上还是一片汪洋,在人类文明出现后,新又是最大!甘肃发现地球上最大的陆生哺乳动物,一头可抵四头大象地球上最大的哺乳动物是蓝鲸,但是它生活在海洋。但是,地球历史上生存过的陆地上最大的哺乳动物是什么呢?中国科学院的研究人员会告诉我们是临县巨犀什么是临县巨犀?近日,中国科学院古脊椎动