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北鲲云为基因测序数据分析提供算力基石

  我国十三五期间对150万人进行了基因组测序,每个人大约产生300-500GB的数据,基因数据总量在十三五末期达到EB级别。而对于宏基因组学,仅1克土壤样品的宏基因组测序就可以产生50TB的原始数据。当前基因组数据正以12-18个月10倍以上的速度增长,远远超过了著名的摩尔定律。
  如何高效处理大规模基因测序数据是高性能处理生物信息分析必须面对的课题 ,而对大规模的生物信息数据的研究将有助于突破健康医疗、环境污染、新能源等领域传统方法的限制,为相关行业的发展提供新的解决方法。
  基因测序数据分析需要海量算力的支持
  基本的数据处理和分析涉及以下四步:第一步, 对测序获取的短序列进行比对拼接 ;第二步,比对拼接后,进行 全基因组基因注释 。包括基因组组分分析,SNP分析,编码基因预测,重复序列注释,Non-codingRNA基因注释,MicroRNA基因注释等;第三步 ,对预测的基因进行功能注释 ;第四步, 比较基因组和分子进化分析 ,如快速进化分析、共线性分析、基因家族分析等。常用的进化树分析软件如 MEGA。
  在整个过程中,需要用到近百种软件。各个软件资源使用特征又差别很大,例如,拼接软件需要大量的内存消耗,比对软件则是典型的数据密集型计算。 复杂的生物信息计算使得生物测序数据的处理和分析需要海量的计算资源,这对高性能计算平台提出了更高的要求。
  如何高效进行基因测序数据分析?
  鉴于许多用户受限于内存容量以及相应的计算能力而不能应用于大规模超长生物序列分析工作,北鲲云提供包括基因测序数据分析软件、计算资源、数据库的整体解决方案,帮助用户解决高通量测序所带来的海量生物数据的存储与处理等问题。 用户无需任何编程基础,无需安装复杂的生物信息数据分析对比软件,无需下载庞大的生物数据库,只需在图形化界面进行简单点击操作,就能在云上搞定基因测序数据分析。
  北鲲云 预装了300+行业主流软件以及Genbank、EMBL等常用参考数据库 ,并提供高性能计算软件及基于各种MPI的自研软件的安装、部署、调试服务;峰值计算能力达到140Pflops,存储容量为10PB,可极大地加快生物测序数据处理过程,提高研究效率。
  数据资源的极速膨胀迫使人们需求一种强有力的工具去分析这些数据,从海量的生物学数据中需求生物学规律,这些规律是解释生命之谜的关键。在这条生命科学的漫漫征程中,北鲲云将紧跟科技的发展和用户需求的变化,持续进行研发迭代升级,伴随生命科学行业一路前行。
  除基因测序数据分析外,北鲲云还提供了蛋白折叠、虚拟筛选、蛋白结构模拟、分子动力学模拟等应用场景的高性能计算解决方案,助力生命科学领域的研究和发展。

12月天象双子座流星雨即将来临,快来收好观测指南太空熊猫君今年的双子座流星雨将在12月14日达到峰值。它在凌晨3点的黑夜中最容易被观察到。今年,虽然盈凸月将会照亮大半个夜晚,掩盖部分流星的光芒,但无论如何,它还是非常值得观赏的!澳大利亚大堡礁数十亿珊瑚集体产卵,宛若海底飞雪Hi,潜水员都关注了IFping!图片来源Shutterstock。comCoralBrunner科学家们上月底在澳大利亚昆士兰州凯恩斯海岸附近的大堡礁见证了珊瑚夜间集体产卵的盛况太阳活动将于2025年达到高峰有何影响?来源新华日报本报记者张宣叶真2019年以来,太阳活动日益频繁,到2025年更将迎来活动最高峰,太阳耀斑日冕物质抛射可能会频繁发生。什么是太阳耀斑?什么是太阳黑子?会对地球产生哪些影热木星是什么天体?为何在太阳系中没有?热木星是指和木星体积质量相仿,但距离主恒星距离非常近,甚至比水星与太阳的距离更近,表面温度非常高的星体。与太阳系不同,目前科学家探测到的外星系中绝大部分都是热木星,到目前为止,关于科学家正在建造地球版黑匣子,记录人类如何灭绝黑匣子,也称飞行记录仪,一般指为调查人员提供重要数据的航空设备,它被安装在空难时最常被完整保留下来的机尾,记录不幸的原因,避免同样的命运。近日,有科学家提出,希望塑造一个巨大的坚不价格太贵,客户太少,商业航天到底怎么玩才能出圈?原作者土星V号来源航天爱好者网NASA选了三家,就一个靠谱的如果说2021年航天界的热词是什么,那毫无疑问是商业航天。三家私人航天企业很巧合的都在今年开始商业旅游航天,当然和龙飞船火山喷发是地球生态的自我修复降温机制之一近几年火山爆发频繁,开始引发全社会尤其是科学界宗教界的思考。现代科学以西方科学为主导,目前现代西方科学的水平和宇宙观比较落后,对火山爆发的根本原因无法做出真正解释,更无法做出准确预利用QCD模拟研究了封闭暗区中的相变一阶相变阶段的符号演示。低能态气泡在空间中任意点成核。如果它们的大小大于临界大小,它们就会膨胀而不是塌缩。膨胀的气泡壁推动黑暗的夸克(黑点)向前,并最终将它们挤压到高能量相的口袋中创造宇宙说明书推荐好书创造宇宙说明书在太阳系,空心的月球里,存在着一个神级文明月球人,他们来自一颗叫圣星的行星,圣星已经被宇宙机制摧毁,月球是他们建造的星球级飞船。月球人在地球上创世造人进行科学地球接收到强烈信号,重复51次来自13亿光年外,人类应该回复吗?在人类还没有进入太空之前的千百年时间里,我们便开始观察宇宙。从最初的肉眼观察星象和月相,到后来出现了望远镜,我们与宇宙虽然在空间上的距离没有缩短,但是人的思维是可以跨越时间与空间。上海交大四人深海科考团队挺进万米深蓝,人类首次抵达雅浦海沟8919米深渊底部12月5日,由上海交大四人深海科考团队,搭乘探索一号科考船,结束了在西太平洋海域的深渊科考任务,返航抵达三亚。这次科考,肖湘教授团队分别下潜到了马里亚纳海沟挑战者深渊底部东西坑及南
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