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陈旧动物皮张古DNA提取方法比较研究获进展

  近日,《动物学研究》(Zoological Research)发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所分子古生物学实验室付巧妹研究团队主导,与云南大学、新疆文物考古研究所、大理大学等合作,完成了以《陈旧动物皮张的古DNA提取方法比较的研究》为题的研究成果。
  保存在博物馆中的动物标本通常是干制皮张标本,由于年代久远,这些样品中的DNA易降解成短片段(50 100bp),陈旧皮张中DNA的含量和质量均远低于新鲜材料,且包含许多来自于环境的污染,故无法以常规的DNA实验方法进行提取和测序。此外,为了有效保存,很多皮张样品经过特殊鞣制处理,这也影响DNA的保存含量与质量。然而,对于一些珍稀保护动物甚至已灭绝动物来说,保存在博物馆里的标本可能是现在唯一能够获得并能开展遗传学研究的生物学材料。
  鲜有针对年代久远的动物皮张样品开展的遗传学研究,此前没有合适的DNA提取方法可直接应用,因而寻找适于陈旧皮张材料的DNA提取方法,需要重新设计实验并进行对比,才能够利用这些宝贵的动物材料开展基因组范围的研究。因此,科研人员专门以古DNA实验室现有DNA提取方法为基础进行方法改良并设计对比实验,以确定改良方法的有效性,探索出一种高效提取陈旧或古代皮张样品DNA的实验方法。
  该研究比较4种提取方法对陈旧皮张DNA提取的有效性,研究比较了所有方法获得的DNA产量和内源短序列数、短序列复杂度、短序列末端损伤、短序列平均长度。结果发现,虽然4种方法均能够有效获取内源DNA片段,但相比于其他方法,改良的古DNA实验室方法可获得更多和更好质量的DNA信息。改良的古DNA实验室方法在获取陈旧皮张DNA方面有一定优势。另外,研究还发现,影响提取效果的原因主要是第二步纯化。研究表明,这一方法可在博物馆保存的陈旧皮张样品的DNA提取方面推广应用。应用这一改良的陈旧皮张DNA提取方法,古DNA实验室已成功获得6例博物馆藏灰狼全基因组信息(Wang et al., 2019, iScience)等珍稀保护动物的DNA信息。
  古脊椎所研究员付巧妹为论文通讯作者,博士张明、高级工程师曹鹏及工程师戴情燕为论文第一作者。研究工作得到中科院战略性先导科技专项(B类)、国家自然科学基金、郑州大学"中华文明根系研究"项目、腾讯"科学探索奖"、霍华德·休斯医学研究所的支持。
  陈旧动物皮张的古对比实验方案设计;量、内源片段质量等结果的对比

太阳系水星水星中国古称辰星到西汉时期,史记天官书作者天文学家司马迁从实际观测发现辰星呈灰色,与五行学说联系在一起,以黑色配水星,因此正式把它命名为水星。水星水星是太阳系的八大行星中最小和最靠最古老的灵长类动物竟与恐龙生活在一起最古老的灵长类动物竟与恐龙生活在一起早在恐龙生存的时代,就已经有哺乳动物了,那么我们人类所属的灵长类在恐龙时代有没有呢?古生物学家最新的研究给了我们答案。地狱溪组地层(HellCr最大三角龙将被拍卖,估价超过千万买一只三角龙要多少钱?最大的那种!一只三角龙的化石要多少钱?而且是个头最大的那种!下个月,法国巴黎的拍卖会将揭晓答案,不过在此之前这具三角龙的化石将在巴黎街头的橱窗中展示一段时间。来自中国的羽毛恐龙是这么换羽毛的来自中国的羽毛恐龙是这么换羽毛的羽毛是鸟类的标志,除了用于飞行,还具有保温炫耀等功能。羽毛并不是耐久不坏的,会定期更换。长羽毛的恐龙也会更换羽毛吗?它们怎么换羽毛呢?古生物学家最近中国奇闻异录中国是一个古老而神奇的地方,千百年来,中国的阴阳学说一直流传至今,虽然在科学事实面前被一次又一次的证明,这属于伪科学或者迷信,然而,一直以来的各种灵异事件却让科学无法解释,从秦始皇日本评价中国军事实力,虽然刻薄但很真实,专家这盆水太凉阅读本文之前,请您先点击一下上面的关注,这样您就可以免费阅读到更多最新的文章了,每天都会有新的内容,完全是免费订阅,请放心关注,如果可以的话请在文章下面留下您宝贵的评论,每天一点点笨重的甲龙竟然是挖坑高手?笨重的甲龙竟然是挖坑高手?甲龙是恐龙家族中的重装步兵,它们虽然笨重而缓慢,但是却拥有超强的防御力。最近古生物学家研究了一具来自蒙古国的甲龙类化石,发现它们还有挖坑的能力!给恐龙搭个化石能源公司债,两位数收益!这样的投资机会不多了事实证明,只要你愿意忍受反对压力,买入石油和天然气公司的高收益债券是一个有利可图的策略。智通财经APP获悉,今年6月,在北海运营钻井平台的IthacaEnergyInc。以9的票面深圳机场(000089。SZ)部分固定资产拟报废处置智通财经APP讯,深圳机场(000089。SZ)发布公告,为打造先行示范区质量发展高地,引领深圳航空物流行业发展,深圳机场与DHL达成战略合作意向,拟在机场国际货站区域设立香港机场深圳机场(000089。SZ)拟3。81亿元投建深圳机场东区国际转运一号货站项目智通财经APP讯,深圳机场(000089。SZ)发布公告,为助力打造高水平空港型国家物流枢纽,进一步满足国内外日益增长的航空快件需求,促进DHL华南航空快件枢纽建设,深圳机场需优化深圳机场(000089。SZ)拟斥2亿元参设股权投资基金主投智慧机场产业链等智通财经APP讯,深圳机场(000089。SZ)发布公告,为进一步拓展公司产业投资布局,加强产融结合,增强公司价值创造能力,促进长远发展,现拟与深圳市资本运营集团有限公司(简称深圳
人类只成功消灭过2种病毒,其中牛瘟曾让一个大陆崩坏原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文七君人类历史上只成功消灭过两个病毒。这两个病毒除了致命以外,都具有能让人类社会崩坏的极大的破坏力。第一是天花,在1980年绝迹。第二个是某政府办公中心打造高效办公环境随着经济的发展,政府办公室作为政府决策服务的参谋助手,是承上启下平衡左右沟通内外协调各方的枢纽部门,也是联系基层联系群众的桥梁和纽带,其工作效能和服务水平的高低直接影响政府决策的正盘点全国各省市十四五新基建发展方向2020年,通过了国民经济和社会发展第十四个五年规划和二三五年远景目标的建议,提出系统布局新型基础设施,加快第五代移动通信工业互联网大数据中心等建设。自2018年新基建首次提出,到航天员返回地球后,为什么需要立即隔离?难道太空也有病毒?文整点科普3个月前,神十二一飞冲天,聂海胜刘伯明汤洪波开始了太空之旅今天,神舟十二号载人飞船与天和舱成功分离,远赴太空出差的三人组也要赶回地球过中秋啦!但是,他们可能无法和家人一起永久冻土层溶解,5种史前生物遗骸被发现,人类或面临超级病毒?文整点科普永久冻土层一般只出现在高纬度或高海拔地区,除了那些生活在极北地区的人之外,其他地方的人很少见到。对于极北地区的人来说,一旦见到永久冻土层溶解,就会万般小心,因为这些冻土可路边立这种黄色支架是在做什么?趣问万物原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文Mirror路边立这种黄色支架是在做什么?图源WikimediaCommons在路边,尤其是工地附近有时会看到几个人支着亮黄色的支架,架灯都关了,怎么还在微微发亮?趣问万物原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文Mirror灯都关了,怎么还在微亮?图源Pixabay小时候关了灯看向天花板,经常会发现灯竟然没完全暗,微弱的余光迟迟不灭。背后原因既不奥运圣火为什么能在水下燃烧?趣问万物原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文Mirror奥运圣火为什么能在水下燃烧?图源Sochi20142000年悉尼奥运会,奥运圣火第一次下水,在大堡礁海水中持续燃烧了3分钟。人从多高的地方落水会摔死?趣问万物原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文Mirror图源Pixabay你可能听说过,从很高的地方跳水,无异于撞击水泥地。水虽为流体,但流体都有一个性质物体速度越快,流体对其施加食品袋里的小卡片为什么能保鲜?趣问万物原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文Mirror食品袋里的小卡片为什么能保鲜?图源小编拍摄食品保鲜根本上是要抑制微生物生长,因为是食物,还得避免影响人体健康和食物风味。除了NASA新报告你没听过的月球运动将在9年后带来大洪水原创文章版权归微信公众号把科学带回家所有撰文七君美国国家航空航天局(NASA)最近在官网发表了一份报告。这份报告指出,由于月球的抖动,9年后美国乃至全球都将迎来更为严重的洪涝灾害。