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科学家发布原核生物泛基因组数据库

  相比于传统的比较基因组学分析,泛基因组学为开展物种基因组动力学、分类及鉴定、致病性和环境适应等研究提供了新视角。近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的原核生物泛基因组数据库(ProPan)正式上线,旨在提供多物种的基因组动力学特征,为物种关键抗性和代谢相关基因鉴定及其演化规律研究提供重要的数据资源。相关研究成果以ProPan: a comprehensive database for profiling prokaryotic pan-genome dynamics为题,在线发表在Nucleic Acid Research上。
  ProPan剖析了多个原核生物物种的基因组动力学特征,并进行了基因簇核苷酸多样性计算、COG功能富集分析、31个关键代谢循环过程及图谱构建、126种物质(包括杀菌剂、抗菌药物和金属)抗性基因预测和基因存在/缺失变异分析等。目前,ProPan收集了432个属的1504个物种(23个古细菌物种、1481个细菌物种)的51,882个基因组(295个古细菌基因组、51587个细菌基因组)和182867222个基因簇。用户可以以物种作为基本单元,进行数据的浏览、搜索和下载。
  研究工作得到中科院战略性先导科技专项、国家自然科学基金、国家重点研发计划等的支持。
  ProPan数据库浏览、搜索及分析展示
  来源:中国科学院北京基因组研究所
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新春专栏丨新春走基层系列报道这里有你的春节记忆吗?岁序常易,华章日新官兵同乐,喜迎新春春节假期倒计时已经开始了而不同兵哥哥的年味体悟也不同这不,小编今天要带大家一起看看咱们武警福建总队官兵所共享的一份春节记忆看看哪些是你也经历过的感谢春节留岗者,说好的补贴奖励一定要兑现新春佳节,万家团圆,但依然还是有相当数量的春节留岗者,在各自岗位上继续工作。春节期间,南都推出我从基层来之新春专题报道,记录快递外卖供电燃气客运医疗警务等城市一线工作者在新春佳节期西蒙斯76人某个2米多的大个实在太软了,哈登还以为他是个硬汉今天76人坐镇主场迎接篮网队的挑战,本场比赛两支球队的关注度非常高,因为西蒙斯和哈登两位球星都是在面对老东家,本场比赛哈登虽然开局没有找到手感,但是随后他就逐渐找到了进攻感觉,并且林书豪官宣新东家!北京时间1月26日,前CBA外援林书豪更新社交媒体,宣布自己正式加盟中国台湾P联赛高雄钢铁人队。随后高雄钢铁人队也官宣了这一消息。本赛季林书豪曾效力于CBA广州队,但在广州未获得太英格拉姆复出让我有些激动这样的比赛会成为动力直播吧1月26日讯因伤缺阵29场的英格拉姆今日复出,但鹈鹕102111不敌森林狼。赛后,英格拉姆接受了媒体采访。我今天迫不及待地很想出战,我感觉很激动,打球真的令人兴奋,我已经缺阵眉有问题!湖人戴维斯复出胜马刺!杜兰特恩比德场外骂战头条创作挑战赛今天的NBA比赛看点是在太多了!首先说说最晚结束比赛的湖人队!面对一直以争状元为己任的马刺,赢球的问题本来就不大,惊喜的是安东尼戴维斯的复出,以及新队员八村塁的加盟首湖人报价威尔巴顿,筹码诚意满满腿伤缺席20场比赛的浓眉哥安东尼戴维斯,26日宣告伤癒复出,虽以替补身份上场,仍有21分12篮板的两双数据,詹姆斯也有20分11助攻与9篮板的准三双表现,携手帮助湖人113比104庙会麦田改停车场?官方已整改麦田是庙会承包地。事先征得了当地村民的同意。他们能这么干,肯定是停车的收益大过麦田本来的收益。一面说着乡村振兴,一面只准老乡种便宜的作物为生,而粮食价格本来就便宜,老乡还就那几亩地消费帮扶运输难?英德邮政来助力日前,在英德市九龙镇政府,中国邮政集团有限公司广东省英德分公司工作人员正将一包包特色农副产品打包装车,发往清远各地的客户手中。感谢英德邮政的帮助,让农副产品能够及时送到客户手中,打这只兔子,十分罕见!老蟾不锁明月宫,飞落西河白兔公。兔子从古至今都是中华传统文化中的瑞兽。在古人的想象和诗词中,玉雪可爱的兔子作为仙女嫦娥的小伙伴和宠物,每天在月球蟾宫行走,在桂树下嬉戏,清辉中拜福。黄渤致敬快递小哥,继续在跑步机上演唱风吹不走我的愿望,马路就像我的家乡穿梭在南北西东,人潮汹涌奔跑的小哥在路上今年春晚,黄渤带来一首致敬快递小哥的歌曲小哥。好玩的是,像2014年央视春晚上演唱我的要求不算高时一样,这