近日，中国科学院海洋研究所沙忠利课题组在胸孔亚派蟹类系统演化方面获得新进展。该研究首次基于线粒体基因组揭示了胸孔亚派四总科的系统进化关系，相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science上。
　　胸孔亚派（Thoracotremata）隶属于甲壳纲（Crustacean）十足目（Decapoda）短尾派（Brachyura），是蟹类中分化程度最高的类群之一。胸孔亚派涵盖4总科18科共1248个物种，其中，沙蟹和方蟹营自由生活，角眼沙蟹被认为是跑得最快的无脊椎动物之一，豆蟹与软体、多毛、棘皮等无脊椎动物共生，珊隐蟹与珊瑚共生。该类群种类繁多，生活方式多样，进化关系复杂，是系统发生学研究的重点和难点。基于线粒体基因组对胸孔亚派的系统演化关系进行有效阐释，对探究其生物多样性，起源演化，生物地理学等具有重要价值。然而，本研究发表前，尚无关于豆蟹和珊隐蟹总科线粒体基因组的报道。
　　该研究获得了沙蟹、方蟹、豆蟹和珊隐蟹总科共12个物种的线粒体基因组序列，在豆蟹和珊隐蟹总科中发现了新的线粒体基因重排模式并重建了基因重排的进化过程，提出了基因重排与胸孔亚派物种生活方式有关的新观点。研究首次阐明了豆蟹和珊隐蟹总科的系统进化地位，豆蟹总科形成单系群，位于进化树最基部位置；珊隐蟹总科与沙蟹总科的一支聚为姐妹群，位于较进化的位置。因此，研究提示，共生生活方式或是胸孔亚派的一个祖征，这种生活方式在珊隐蟹中得以保留。研究进一步阐释了沙蟹和方蟹总科内部科的系统进化关系，并建议将沙蟹总科大眼蟹科Macrophthalmidae的霍氏三强蟹Tritodynamia horvathi归入方蟹总科弓蟹科Varunidae。
　　研究工作得到国家杰出青年科学基金、中科院前沿科学重点研究计划及中科院战略性先导科技专项等的支持。
　　胸孔亚派线粒体基因重排的进化过程
　　胸孔亚派系统进化关系BI（左）和ML（右）

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