美国国家生物技术信息中心的基因表达数据库（GEO）项目是为了应对高通量基因表达数据公共存储库日益增长的需求而发起的。基因表达数据库（GEO）提供了灵活和开放的设计，便于从高通量基因表达和基因组杂交实验中提交、存储和检索不同类型的数据集。基因表达数据库（GEO）的目的不是要取代内部的基因表达数据库，这些数据库受益于连贯的数据集，并且构建这些数据库是为了促进特定的分析方法，而是通过充当第三级中央数据分发中心来补充这些数据库。基因表达数据库（GEO）的三个核心数据实体是平台、样本和系列，设计时考虑到了基因表达和基因组杂交实验。从本质上讲，平台是一系列探针，它们定义了可以检测到的分子集。一个样本描述了正在被探测的一组分子，并引用了用于生成其分子丰度数据的单一平台。一系列将样本组织成有意义的数据集，这些数据集构成了一个实验。基因表达数据库（GEO）可通过万维网公开访问。 网源网络 设计 基因表达数据库（GEO）将数据分成三个主要组件，平台、样本和系列，每个组件都在关系数据库中访问(即给定唯一和恒定的标识符)。为了实现开放和灵活的设计，允许存储和检索非常不同的数据类型，数据没有在数据库中完全细化。取而代之的是，为每个平台和每个示例存储制表符分隔的ASCII表。该表由多个列以及相应的列标题名称组成。此表中的数据目前部分提取用于编制索引，但可能会进一步提取以进行更广泛的搜索和检索。此外，提交者可提供任意数量的补充列，以包括提交者定义的附加信息。 图源网络 平台的实例本质上是一系列探针，它们定义了在利用该平台的任何实验中可以检测到的分子集。例如，平台数据表可以包含标识每个探针(SPOT)的位置和生物试剂含量的GEO定义的列，诸如GenBank登录号、开放阅读框架(ORF)名称和克隆识别符，以及提交者定义的列。平台登录号有一个‘GPL’前缀。 一个样本的实例描述了正在被探测的一组分子的派生，并利用平台来产生分子丰度数据。每个样本都有且只能有一个必须预先定义的父平台。例如，样本数据表可以包含指示在其平台中定义的相应斑点的最终相关丰度值的列，以及任何其他由GEO定义的(例如，原始信号、背景信号)和提交者定义的列。样本登录号有一个‘GSM’前缀。 序列的实例将样本组织成组成实验的有意义的数据集，并由共同的属性绑定在一起。系列登录号有一个‘GSE’前缀。 提交 对于新提交的和更新的提交，有两种通信模式可用，即交互或直接存放。交互式Web表单界面路线简单明了，最适合偶尔提交数量相对较少的样本。通过直接存放简单总括格式(SOFT)的文件，可以将大量提交的大量数据集迅速并入地球观测组织。SOFT是一种基于行的ASCII文本格式，允许在一个文件中表示多个GEO平台、样本和系列。在Soft中，元数据显示为标签-值对，并与平台和示例的制表符分隔的文本表相关联。Soft的设计使其易于使用现成的行扫描软件进行操作，并且可以非常容易地从电子表格、数据库和分析软件中生成或导入其中。有关SOFT和提交过程的更多信息，可从网站获得。 提交可以私下保存最多6个月；这项政策允许数据发布与稿件发布一致。这些提交的材料有一个最终的加入号，可能会在出版物中引用。在这一点上，提交的文件不是经过整理的，而是经过人工扫描，以确保满足最低基本要求。通过使用数据表中的标准列标题并提供足够的补充信息，使数据对其他人有用完全取决于提交者。 搜索和检索 在编写本报告时，仅通过登录号就可以检索完整的平台、样本和系列提交的材料。对GEO中的数据进行了广泛的索引和链接，并可通过名为Entrez ProbeSet的新Entrez数据库进行查询。这个数据库的Web界面使用与其他流行的NCBI资源(如PubMed和GenBank)相似的索引和链接引擎。与任何其他Entrez数据库一样，可以输入一个简单的布尔短语，并将其限制为任何数量的受支持属性字段。匹配项链接到完整的GEO条目以及其他Entrez数据库--目前是核苷酸、分类和PubMed-以及相关的Entrez ProbeSet条目。Entrez ProbeSet可通过Entrez网站作为用于选择要查询的Entrez数据库的下拉菜单之一进行访问。 未来的发展 基因表达数据库（GEO）正在不断开发，目的是改进其索引、链接、搜索和显示能力，以便能够进行更有力的数据挖掘。作为GEO储存库的扩展，我们目前正在开发一个完全细化的丰度测量数据库，该数据库将允许查询和检索单个丰度测量结果。然而，在当前高通量基因表达和基因组杂交实验的复杂性和快速发展带来的限制下，丰度测量可能只在类似派生的小组数据集内具有可比性。我们计划利用这些可比较的数据子集，以便尽可能多地查询丰度测量数据，以及提供这些数据的有用的概观。 英文原文 Edgar R, Domrachev M, Lash AE. Gene Expression Omnibus: NCBI gene expression and hybridization array data repository. Nucleic Acids Res. 2002 Jan 1;30(1):207-10. doi: 10.1093/nar/30.1.207. PMID: 11752295; PMCID: PMC99122.
太阳报C罗退役后会回葡萄牙生活新宅建造成本1700万英镑根据太阳报的消息，C罗新宅的建造成本大幅度地提升了，从1000万英镑提升至1700万英镑。葡萄牙巨星的新宅位于葡萄牙金塔达马林哈度假村，C罗原本的预算是1000万英镑，但是由于材料618来了！收好这份手机选购攻略及推荐清单前言要说现在手机市场竞争真的是激烈，很多人都被各种参数和配置搞得一头雾水，趁这个机会讲讲手机选购的小知识以及最近值得入手的手机好价清单，希望对近期有意向购买手机的朋友有所帮助。手机618各价位手机推荐，想换机的朋友来看看目前正值618期间，是一年中购买电子产品的最佳时期。也是高考刚结束的时候，很多毕业的同学们要买一部手机。无论你是想买一部预算多少的手机，下面我将推荐几部不同价位的手机，各位可以直接三星zfilp4真机曝光，折痕明显减少，电池是3700毫安三星zfilp4曝光了真机，看起来和zfilp3没有什么区别？折痕明显是减少了，这是一个进步，毕竟折叠屏手机厂商最近还是在努力减少屏幕折痕的，但能看到手机还是有缝隙，尤其是在翻盖的三星GalaxyZFlip4真机曝光挤牙膏？电池更大，折痕更浅近日，有网友在网上晒出三星GalaxyZFlip4的真机照，从图片上来看，该机与上一代三星GalaxyZFlip3区别不大，仍旧主打小巧轻便的纵向折叠屏方案，难道这次三星还是挤牙膏办公与娱乐两全其美三星GalaxyZFold35G给你与众不同的感受在折叠屏领域，三星始终通过不断的创新赋能前沿科技产品，三星第三代折叠屏手机GalaxyZFold35G的问世，具有里程碑般的价值，不仅在移动办公中实现高效便捷的体验，充分释放生产力三星GalaxyZFold4曝光，GalaxyZFold3沦为百元机改写低价史众所周知，三星在全球手机市场占有很大的市场份额，RD能力非常强，每年都能给消费者带来耳目一新的产品。近年来，折叠屏手机发展迅速。三星ZFold系列机型经过几次迭代，各方面已经相对成一加骁龙8新机曝光骁龙8芯片150W快充，外观有点随着上个月骁龙8的发布，各厂商都准备在下半年发布的骁龙8旗舰，最早预计会在7月发布。现在关于一加骁龙8的手机已经曝光了，其可能命名为一加10和10T，一加10T这也可能是一加今年最云游非遗2300余部非遗纪录影像展播，光影中感受非遗魅力记者李睿实习生李菁光影迷离的皮影戏巧夺天工的刺绣瑰丽璀璨的唐卡非物质文化遗产是人类文明漫长发展过程中产生的文化艺术结晶。6月11日是我国第17个文化和自然遗产日，今年的文化和自然遗阿里巴巴腾讯和华为，哪个公司对社会贡献较大？对于这个问题，不同的人有不同的看法。在我看来，阿里巴巴应该是对社会做出巨大贡献的企业。我主要从他们的业务线来划分。阿里巴巴是一家主要从事电子商务的公司。它的淘宝和支付宝彻底改变了人无线蓝牙耳机哪个品牌最好？飞利浦618狂欢节惊喜不断618狂欢节来了，不少人都会在这个好时机购买耳机等数码产品，想要挑选一款音质比较好，颜值比较高，配置比较全的蓝牙无线耳机并非易事。说起耳机品牌，飞利浦拥有多年的经验积累，凭借着亲民