对《内经》进行分类编订的注本。原书三十卷。隋杨上善撰注。现行版本为清萧延平依据从日本获得的唐人卷手抄本，本书还参考其他一些抄本，以及《素问》、《灵枢》等书，进行校正编次而成。共二十三卷。成书年代不详。
　　杨上善，籍贯及生卒年无考，据《古今医统》载，杨氏在隋大业年间曾任太医侍御，精于医术；或云其曾任太子文学之职，很有名望。杨氏为注解《内经》最早医家之一。萧延平无考。
　　本书是最早对《内经》进行类编和作注的本子。从南宋时起，即已湮没，至清代光绪年间在日本始获得日人抄本（据考，其抄录年代相当于我国唐僖宗光启三年，即887年），影录回国，方使我国又重有该书之传本。
　　本书原缺第一、第四、第七、第十六、第十八、第二十、第二十一等七卷，其它各卷亦有部分残缺。近年在日本，又发现了原缺的第十八卷、第二十一卷及第二十二卷全文，故国内已有内部复印卷本。
　　本书从分类、注释和校勘三方面对《内经》进行了整理和研究。杨氏将《素问》和《灵枢》原篇折散，再按内容重新分类编次。即卷二为摄生；卷三为阴阳；卷五为人合；卷六为脏腑；卷八至卷十为经脉；卷十一为腧穴；卷十二为营卫气；卷十三为身度；卷十四至卷十五为诊候；卷十七为证候；卷十九为设方；卷二十二至卷二十三为九针；卷二十四为补泻；卷二十五为伤寒；卷二十六为寒热；卷二十七为邪论；卷二十八为风论；卷二十九为气论；卷三十为杂病；附篇则载《太素》遗文及杨氏原注。《内经》理论经杨氏如此分类编注，则更为系统，而且初步勾划出了中医学基础理论的体系轮廓，其分类虽较繁杂，但却无支离破碎之弊。此外，本书以《说文解字》和《尔雅》为根据，对《内经》的部分文字进行了诠释与校勘，其训诂优于王冰注本，其注释则较为精当，多有阐发，从而使经文更加易于理解。而且，在注释中引录了不少古典医著的佚文，具有重要的研究价值。总之，本书确是一本研究《内经》学术的重要的参考文献。
　　本书现存主要版本有：日本天保五年（1834年）奈须恒德写本、日本天保十年（1839年）坂立节春璋和倩皋写本、清光绪二十三年丁酉（1897年）通隐堂刻本、一九二四年兰陵堂仿宋嘉祐刻本及《丛书集成》本。一九八一年人民卫生出版社曾铅印出版。

《巴予藉别传》原文及鉴赏予藉故富家，生而通敏，眉目疏秀，身纤而晳。少好刻印，务穷其学，旁及钟鼎款识、秦汉石刻。遂工隶书，劲险飞动，有建宁延喜遗意。又益搜古书画、器用，及琢研造墨，究极精美。罗列左右，入……《观渔》原文及鉴赏渔于池者，沉其网而左右縻之。网之缘出水可寸许，缘愈狭鱼之跃者愈多。有入者，有出者，有屡跃而不出者。皆经其缘而见之。安知夫鱼之跃而出者，不自以为得耶？又安知夫跃而不出，与跃而反入……《钵山余霞阁记》原文及鉴赏江宁城，山得其半。便于人而适于野者，惟西城钵山，吾友陶子静偕群弟读书所也。因山之高下为屋，而阁于其巅，曰余霞，因所见而名之也。俯视花木，皆环拱升降，草径曲折可念，行人若飞……《士说》原文及鉴赏求栋梁者必于木，而木不皆栋梁者也。其不材者，且不得与萑、蒲、竹、箭比。其实异，其名同，吾见夫木之难求也。然而求栋梁者不求之萑、蒲、竹、箭之林，而断断然必求之木。士之于国，……《金孺人画山水序》原文及鉴赏尝以后世一切之言皆出于经，独至穷山川之幽灵，嗟叹草木之华实，文人思女，或名其家，或以寄其不齐乎凡民之心，至一往而不可止，是不知其所出。尝以叩吾客，客曰：“是出于老、庄耳。”老、……《病梅馆记》原文及鉴赏江宁之龙蟠，苏州之邓尉，杭州之西溪，皆产梅。或曰：梅以曲为美，直则无姿；以欹为美，正则无景；梅以疏为美，密则无态。固也。此文人画士，心知其意，未可明诏大号，以绳天下之梅也；又不……《书咏兰诗后》原文及鉴赏兰为国香，东南山泽涧多产之，当春深时，幽岩曲涧，窈然自芳。然往往有虫啮之，自其华初生时，辄已被啮而萎，即幸而能自发荣，亡何又辄萎。其幸得脱者，仅十二三焉，而众草蒙翳，条达畅遂，……《鸟说》余读书之室，其旁有桂一株焉。桂之上，日有声然者，即而视之，则二鸟巢于其枝干之间，去地不五六尺，人手能及之。巢大如盏，精密完固，细草盘结而成。鸟雌一雄一，小不能盈掬，色明洁，娟皎……《辕马说》原文及鉴赏余行塞上，乘任载之车，见马之负辕者而感焉。古之车，独辀加衡而服两马。今则一马夹辕而驾，领局于轭，背承乎韅，靳前而靽后。其登阤也，气尽喘汗，而后能引其轮之却也。其下阤也，股蹙蹄攒……《婢音哀辞》原文及鉴赏婢音，仆王兴所生也。九岁，入侍吾母，洒扫浣濯如成人。稍长，于女事无不能。奉事八年，未尝以微失致呵诘。其群居，未尝笑嬉妄出一语。余蒙难，家人御吾母北上。音随吾妹，日夕相扶持……《簾珠记》原文及鉴赏高子病痿，不出内户者旬月。客散拥榻，目无所寄，则常属之窗与簾。簾附窗，而嫟于壁，壁之穴虫多缘而游。有蛛初来登簾，若涉大险。簾有界隙，动辄失足，失足则惊，惊辄退缩不敢前，则惴惴而……《种兰》原文及鉴赏余种兰数十盆，三春告莫，皆有憔悴思归之色。因移植于太湖石黄石之间，山之阴，石之缝，既已避日，又就燥，对吾堂亦不恶也。来年忽发箭数十，挺然直上，香味坚厚而远。又一年更茂。乃知物亦……