用远古DNA解读人类历史

　　今年是20岁第人类基因组测序周年纪念日。为纪念这一事件，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所傅巧梅教授带领的研究小组回顾了古DNA（aDNA）领域的最新进展，即从过去生物的遗骸中获取的DNA。
　　这篇评论题为＂洞察人类历史从古代的第一个十年人类基因组学＂，发表于科学类我们9点23分
　　古代的DNA研究始于短的DNA片段，后来由于高通量测序（HTS）技术的广泛应用而得到了发展。2010年，三个古代基因组草案（即尼安德特人、杰尼索万人和格陵兰4000年前的现代人类）的出版标志着aDNA研究进入了一个新的时代。
　　已经灭绝的古人类（即尼安德特人和丹尼索瓦人）的基因组已经被重建。重要的是，杰尼索瓦人首先是通过使用aDNA数据来确定的。这两个古老的血统被证明与现代人类分离了约55万年前（ka）。它们随后彼此分离约400千安。
　　这些aDNA分析表明，在~550ka分离之后，古代和现代人类并没有保持孤立。在古代人类（即尼安德特人和丹尼索瓦人）和现代人之间，已经发现了多个渗透波。此外，这两个古老的血统混合在一起，如一个50 kyr的古老个体（Denisova 11）所示，他母亲是尼安德特人，父亲是丹尼索瓦人。
　　至于早期的现代人类，基因数据支持起源于非洲。然而，仍然很难确定一个单一的模式来描述非洲祖先的起源。无论如何，在大约250-200千年之间的某个时候，在非洲，有助于早期现代人类祖先的五个主要分支开始在短时间内彼此分离。
　　在欧亚大陆，从早期就获得了基因组数据现代人最早可以追溯到45千年前。这些数据揭示了几个早期的现代人类谱系。它们中的一些与后来的种群没有可检测的遗传连续性，而其他的，包括那些代表古代北西伯利亚人、古代欧洲人和古代亚洲人的人，可能在基因上与今天有联系人口. 随着时间的推移人口结构欧亚大陆的人口相互作用更大，迁移率更高。
　　傅教授说：＂上一次冰期最大期（LGM）是27-19千年之间的一个严酷时期，欧洲、东亚和西伯利亚都观察到了人口的变化。冰川期结束后，气候变暖、更加稳定，人类人口不断扩张、迁移和相互作用。＂。
　　古代DNA研究有效地拓宽了我们对人类历史的理解。然而，我们只是潜入了地下。需要付出更多的努力。这应包括从30 kyr以上的基因组和非洲、亚洲和大洋洲等地区进一步取样；利用蛋白质组学、同位素、微生物组学和表观遗传学等其他古老的分子信息，进一步扩大aDNA的研究范围；进一步探索适应性变体。
　　除了扩大我们对人类历史的了解，aDNA研究也增进了我们对人类生物学的了解。探索人类过去如何适应极端环境，如LGM和传染源，将有助于我们在未来面临新的挑战，如气候变化和更多的流行病。